Protein–RNA interactions for Protein: Q5K651

SAMD9, Sterile alpha motif domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,589 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD9Q5K651 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
SAMD9Q5K651 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC43.21■■■■■ 4.51
SAMD9Q5K651 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
SAMD9Q5K651 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC43.19■■■■■ 4.51
SAMD9Q5K651 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
SAMD9Q5K651 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
SAMD9Q5K651 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC43.16■■■■■ 4.5
SAMD9Q5K651 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
SAMD9Q5K651 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC43.15■■■■■ 4.5
SAMD9Q5K651 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
SAMD9Q5K651 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
SAMD9Q5K651 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC43.12■■■■■ 4.49
SAMD9Q5K651 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC43.12■■■■■ 4.49
SAMD9Q5K651 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
SAMD9Q5K651 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC43.1■■■■■ 4.49
SAMD9Q5K651 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC43.09■■■■■ 4.49
SAMD9Q5K651 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC43.07■■■■■ 4.49
SAMD9Q5K651 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
SAMD9Q5K651 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
SAMD9Q5K651 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC43.06■■■■■ 4.48
SAMD9Q5K651 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.05■■■■■ 4.48
SAMD9Q5K651 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC43.04■■■■■ 4.48
SAMD9Q5K651 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
SAMD9Q5K651 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC43.03■■■■■ 4.48
SAMD9Q5K651 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC43.03■■■■■ 4.48
SAMD9Q5K651 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
SAMD9Q5K651 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
SAMD9Q5K651 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
SAMD9Q5K651 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC42.99■■■■■ 4.47
SAMD9Q5K651 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC42.99■■■■■ 4.47
SAMD9Q5K651 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
SAMD9Q5K651 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
SAMD9Q5K651 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
SAMD9Q5K651 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC42.97■■■■■ 4.47
SAMD9Q5K651 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
SAMD9Q5K651 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC42.95■■■■■ 4.47
SAMD9Q5K651 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC42.94■■■■■ 4.46
SAMD9Q5K651 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
SAMD9Q5K651 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
SAMD9Q5K651 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC42.93■■■■■ 4.46
SAMD9Q5K651 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
SAMD9Q5K651 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
SAMD9Q5K651 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
SAMD9Q5K651 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.9■■■■■ 4.46
SAMD9Q5K651 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
SAMD9Q5K651 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
SAMD9Q5K651 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC42.88■■■■■ 4.46
SAMD9Q5K651 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC42.88■■■■■ 4.46
SAMD9Q5K651 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC42.88■■■■■ 4.45
SAMD9Q5K651 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC42.87■■■■■ 4.45
SAMD9Q5K651 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC42.87■■■■■ 4.45
SAMD9Q5K651 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC42.87■■■■■ 4.45
SAMD9Q5K651 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC42.86■■■■■ 4.45
SAMD9Q5K651 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.86■■■■■ 4.45
SAMD9Q5K651 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.86■■■■■ 4.45
SAMD9Q5K651 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
SAMD9Q5K651 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC42.84■■■■■ 4.45
SAMD9Q5K651 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
SAMD9Q5K651 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
SAMD9Q5K651 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
SAMD9Q5K651 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.8■■■■■ 4.44
SAMD9Q5K651 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
SAMD9Q5K651 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
SAMD9Q5K651 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
SAMD9Q5K651 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
SAMD9Q5K651 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC42.78■■■■■ 4.44
SAMD9Q5K651 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC42.78■■■■■ 4.44
SAMD9Q5K651 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC42.78■■■■■ 4.44
SAMD9Q5K651 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
SAMD9Q5K651 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC42.78■■■■■ 4.44
SAMD9Q5K651 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC42.76■■■■■ 4.44
SAMD9Q5K651 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC42.75■■■■■ 4.43
SAMD9Q5K651 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
SAMD9Q5K651 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
SAMD9Q5K651 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC42.74■■■■■ 4.43
SAMD9Q5K651 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC42.74■■■■■ 4.43
SAMD9Q5K651 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.73■■■■■ 4.43
SAMD9Q5K651 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
SAMD9Q5K651 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
SAMD9Q5K651 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
SAMD9Q5K651 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
SAMD9Q5K651 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC42.72■■■■■ 4.43
SAMD9Q5K651 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC42.71■■■■■ 4.43
SAMD9Q5K651 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
SAMD9Q5K651 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
SAMD9Q5K651 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
SAMD9Q5K651 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.67■■■■■ 4.42
SAMD9Q5K651 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
SAMD9Q5K651 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
SAMD9Q5K651 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC42.65■■■■■ 4.42
SAMD9Q5K651 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC42.65■■■■■ 4.42
SAMD9Q5K651 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
SAMD9Q5K651 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC42.63■■■■■ 4.42
SAMD9Q5K651 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
SAMD9Q5K651 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
SAMD9Q5K651 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
SAMD9Q5K651 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC42.6■■■■■ 4.41
SAMD9Q5K651 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
SAMD9Q5K651 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
SAMD9Q5K651 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC42.56■■■■■ 4.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms