Protein–RNA interactions for Protein: Q58EX2

SDK2, Protein sidekick-2, humanhuman

Predictions only

Length 2,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDK2Q58EX2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDK2Q58EX2 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDK2Q58EX2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SDK2Q58EX2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SDK2Q58EX2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SDK2Q58EX2 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDK2Q58EX2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDK2Q58EX2 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDK2Q58EX2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SDK2Q58EX2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SDK2Q58EX2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SDK2Q58EX2 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDK2Q58EX2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SDK2Q58EX2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDK2Q58EX2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDK2Q58EX2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDK2Q58EX2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SDK2Q58EX2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SDK2Q58EX2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDK2Q58EX2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDK2Q58EX2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDK2Q58EX2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SDK2Q58EX2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SDK2Q58EX2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDK2Q58EX2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDK2Q58EX2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SDK2Q58EX2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDK2Q58EX2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDK2Q58EX2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SDK2Q58EX2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDK2Q58EX2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDK2Q58EX2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SDK2Q58EX2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SDK2Q58EX2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SDK2Q58EX2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SDK2Q58EX2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SDK2Q58EX2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
SDK2Q58EX2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SDK2Q58EX2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
SDK2Q58EX2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SDK2Q58EX2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SDK2Q58EX2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SDK2Q58EX2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SDK2Q58EX2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SDK2Q58EX2 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SDK2Q58EX2 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SDK2Q58EX2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SDK2Q58EX2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SDK2Q58EX2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
SDK2Q58EX2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SDK2Q58EX2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
SDK2Q58EX2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDK2Q58EX2 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SDK2Q58EX2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SDK2Q58EX2 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDK2Q58EX2 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SDK2Q58EX2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDK2Q58EX2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SDK2Q58EX2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDK2Q58EX2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDK2Q58EX2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDK2Q58EX2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDK2Q58EX2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SDK2Q58EX2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDK2Q58EX2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDK2Q58EX2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDK2Q58EX2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SDK2Q58EX2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDK2Q58EX2 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SDK2Q58EX2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SDK2Q58EX2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SDK2Q58EX2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SDK2Q58EX2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SDK2Q58EX2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SDK2Q58EX2 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDK2Q58EX2 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SDK2Q58EX2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDK2Q58EX2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDK2Q58EX2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SDK2Q58EX2 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDK2Q58EX2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SDK2Q58EX2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDK2Q58EX2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDK2Q58EX2 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SDK2Q58EX2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDK2Q58EX2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDK2Q58EX2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SDK2Q58EX2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SDK2Q58EX2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SDK2Q58EX2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDK2Q58EX2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDK2Q58EX2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SDK2Q58EX2 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDK2Q58EX2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDK2Q58EX2 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SDK2Q58EX2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDK2Q58EX2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SDK2Q58EX2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SDK2Q58EX2 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SDK2Q58EX2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms