Protein–RNA interactions for Protein: Q3LI58

KRTAP21-1, Keratin-associated protein 21-1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP21-1Q3LI58 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.14□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC4.13□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC4.12□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC4.11□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC4.11□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC4.11□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.11□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC4.1□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
KRTAP21-1Q3LI58 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC4.07□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC4.06□□□□□ -1.76
KRTAP21-1Q3LI58 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.06□□□□□ -1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms