Protein–RNA interactions for Protein: Q32MK0

MYLK3, Myosin light chain kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 819 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYLK3Q32MK0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
MYLK3Q32MK0 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYLK3Q32MK0 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYLK3Q32MK0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MYLK3Q32MK0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
MYLK3Q32MK0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MYLK3Q32MK0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYLK3Q32MK0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MYLK3Q32MK0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYLK3Q32MK0 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MYLK3Q32MK0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
MYLK3Q32MK0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
MYLK3Q32MK0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MYLK3Q32MK0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYLK3Q32MK0 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MYLK3Q32MK0 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MYLK3Q32MK0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MYLK3Q32MK0 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MYLK3Q32MK0 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYLK3Q32MK0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYLK3Q32MK0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MYLK3Q32MK0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MYLK3Q32MK0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MYLK3Q32MK0 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYLK3Q32MK0 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYLK3Q32MK0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYLK3Q32MK0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYLK3Q32MK0 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYLK3Q32MK0 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYLK3Q32MK0 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MYLK3Q32MK0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MYLK3Q32MK0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYLK3Q32MK0 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MYLK3Q32MK0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MYLK3Q32MK0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27■■□□□ 1.91
MYLK3Q32MK0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MYLK3Q32MK0 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYLK3Q32MK0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYLK3Q32MK0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYLK3Q32MK0 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYLK3Q32MK0 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MYLK3Q32MK0 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYLK3Q32MK0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
MYLK3Q32MK0 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
MYLK3Q32MK0 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYLK3Q32MK0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYLK3Q32MK0 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MYLK3Q32MK0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYLK3Q32MK0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MYLK3Q32MK0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYLK3Q32MK0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYLK3Q32MK0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MYLK3Q32MK0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
MYLK3Q32MK0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MYLK3Q32MK0 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MYLK3Q32MK0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MYLK3Q32MK0 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MYLK3Q32MK0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYLK3Q32MK0 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYLK3Q32MK0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYLK3Q32MK0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYLK3Q32MK0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYLK3Q32MK0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MYLK3Q32MK0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
MYLK3Q32MK0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MYLK3Q32MK0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
MYLK3Q32MK0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
MYLK3Q32MK0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYLK3Q32MK0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYLK3Q32MK0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYLK3Q32MK0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYLK3Q32MK0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
MYLK3Q32MK0 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYLK3Q32MK0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
MYLK3Q32MK0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYLK3Q32MK0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYLK3Q32MK0 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
MYLK3Q32MK0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYLK3Q32MK0 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
MYLK3Q32MK0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYLK3Q32MK0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
MYLK3Q32MK0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYLK3Q32MK0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYLK3Q32MK0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
MYLK3Q32MK0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYLK3Q32MK0 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
MYLK3Q32MK0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYLK3Q32MK0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
MYLK3Q32MK0 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
MYLK3Q32MK0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYLK3Q32MK0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYLK3Q32MK0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
MYLK3Q32MK0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYLK3Q32MK0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
MYLK3Q32MK0 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
MYLK3Q32MK0 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYLK3Q32MK0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
MYLK3Q32MK0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYLK3Q32MK0 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
MYLK3Q32MK0 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms