Protein–RNA interactions for Protein: Q2V2M9

FHOD3, FH1/FH2 domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FHOD3Q2V2M9 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.03■■■■■ 4.48
FHOD3Q2V2M9 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC43.03■■■■■ 4.48
FHOD3Q2V2M9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC43.03■■■■■ 4.48
FHOD3Q2V2M9 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC43.03■■■■■ 4.48
FHOD3Q2V2M9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
FHOD3Q2V2M9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.02■■■■■ 4.48
FHOD3Q2V2M9 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
FHOD3Q2V2M9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC43.01■■■■■ 4.48
FHOD3Q2V2M9 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC43■■■■■ 4.47
FHOD3Q2V2M9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.99■■■■■ 4.47
FHOD3Q2V2M9 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
FHOD3Q2V2M9 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
FHOD3Q2V2M9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.95■■■■■ 4.47
FHOD3Q2V2M9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.47
FHOD3Q2V2M9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.93■■■■■ 4.46
FHOD3Q2V2M9 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
FHOD3Q2V2M9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC42.92■■■■■ 4.46
FHOD3Q2V2M9 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
FHOD3Q2V2M9 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
FHOD3Q2V2M9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
FHOD3Q2V2M9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
FHOD3Q2V2M9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.91■■■■■ 4.46
FHOD3Q2V2M9 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
FHOD3Q2V2M9 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC42.87■■■■■ 4.45
FHOD3Q2V2M9 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC42.87■■■■■ 4.45
FHOD3Q2V2M9 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
FHOD3Q2V2M9 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
FHOD3Q2V2M9 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
FHOD3Q2V2M9 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
FHOD3Q2V2M9 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
FHOD3Q2V2M9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC42.84■■■■■ 4.45
FHOD3Q2V2M9 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC42.84■■■■■ 4.45
FHOD3Q2V2M9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC42.83■■■■■ 4.45
FHOD3Q2V2M9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC42.82■■■■■ 4.45
FHOD3Q2V2M9 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
FHOD3Q2V2M9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
FHOD3Q2V2M9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
FHOD3Q2V2M9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC42.8■■■■■ 4.44
FHOD3Q2V2M9 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
FHOD3Q2V2M9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC42.79■■■■■ 4.44
FHOD3Q2V2M9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
FHOD3Q2V2M9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
FHOD3Q2V2M9 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.77■■■■■ 4.44
FHOD3Q2V2M9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
FHOD3Q2V2M9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
FHOD3Q2V2M9 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
FHOD3Q2V2M9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
FHOD3Q2V2M9 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
FHOD3Q2V2M9 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC42.7■■■■■ 4.43
FHOD3Q2V2M9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC42.7■■■■■ 4.43
FHOD3Q2V2M9 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC42.69■■■■■ 4.42
FHOD3Q2V2M9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC42.69■■■■■ 4.42
FHOD3Q2V2M9 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC42.66■■■■■ 4.42
FHOD3Q2V2M9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
FHOD3Q2V2M9 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC42.64■■■■■ 4.42
FHOD3Q2V2M9 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC42.64■■■■■ 4.42
FHOD3Q2V2M9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.64■■■■■ 4.42
FHOD3Q2V2M9 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
FHOD3Q2V2M9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
FHOD3Q2V2M9 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
FHOD3Q2V2M9 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
FHOD3Q2V2M9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC42.62■■■■■ 4.41
FHOD3Q2V2M9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
FHOD3Q2V2M9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.61■■■■■ 4.41
FHOD3Q2V2M9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
FHOD3Q2V2M9 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC42.61■■■■■ 4.41
FHOD3Q2V2M9 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC42.61■■■■■ 4.41
FHOD3Q2V2M9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
FHOD3Q2V2M9 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
FHOD3Q2V2M9 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC42.59■■■■■ 4.41
FHOD3Q2V2M9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC42.59■■■■■ 4.41
FHOD3Q2V2M9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC42.58■■■■■ 4.41
FHOD3Q2V2M9 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC42.58■■■■■ 4.41
FHOD3Q2V2M9 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.4
FHOD3Q2V2M9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC42.55■■■■■ 4.4
FHOD3Q2V2M9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC42.55■■■■■ 4.4
FHOD3Q2V2M9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC42.55■■■■■ 4.4
FHOD3Q2V2M9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
FHOD3Q2V2M9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.54■■■■■ 4.4
FHOD3Q2V2M9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
FHOD3Q2V2M9 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC42.51■■■■■ 4.4
FHOD3Q2V2M9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
FHOD3Q2V2M9 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
FHOD3Q2V2M9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
FHOD3Q2V2M9 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.48■■■■■ 4.39
FHOD3Q2V2M9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
FHOD3Q2V2M9 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC42.45■■■■■ 4.39
FHOD3Q2V2M9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
FHOD3Q2V2M9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
FHOD3Q2V2M9 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC42.43■■■■■ 4.38
FHOD3Q2V2M9 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC42.41■■■■■ 4.38
FHOD3Q2V2M9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
FHOD3Q2V2M9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.4■■■■■ 4.38
FHOD3Q2V2M9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.37
FHOD3Q2V2M9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC42.38■■■■■ 4.37
FHOD3Q2V2M9 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC42.37■■■■■ 4.37
FHOD3Q2V2M9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
FHOD3Q2V2M9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
FHOD3Q2V2M9 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
FHOD3Q2V2M9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.37■■■■■ 4.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms