Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
GEN1Q17RS7 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
GEN1Q17RS7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
GEN1Q17RS7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
GEN1Q17RS7 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GEN1Q17RS7 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
GEN1Q17RS7 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GEN1Q17RS7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
GEN1Q17RS7 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GEN1Q17RS7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GEN1Q17RS7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GEN1Q17RS7 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
GEN1Q17RS7 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
GEN1Q17RS7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GEN1Q17RS7 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
GEN1Q17RS7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GEN1Q17RS7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
GEN1Q17RS7 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
GEN1Q17RS7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GEN1Q17RS7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GEN1Q17RS7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
GEN1Q17RS7 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
GEN1Q17RS7 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GEN1Q17RS7 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
GEN1Q17RS7 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GEN1Q17RS7 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GEN1Q17RS7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GEN1Q17RS7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
GEN1Q17RS7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GEN1Q17RS7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
GEN1Q17RS7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
GEN1Q17RS7 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GEN1Q17RS7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GEN1Q17RS7 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GEN1Q17RS7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
GEN1Q17RS7 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GEN1Q17RS7 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
GEN1Q17RS7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GEN1Q17RS7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GEN1Q17RS7 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
GEN1Q17RS7 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GEN1Q17RS7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
GEN1Q17RS7 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
GEN1Q17RS7 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
GEN1Q17RS7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
GEN1Q17RS7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
GEN1Q17RS7 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
GEN1Q17RS7 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GEN1Q17RS7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
GEN1Q17RS7 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GEN1Q17RS7 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
GEN1Q17RS7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GEN1Q17RS7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GEN1Q17RS7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
GEN1Q17RS7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
GEN1Q17RS7 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
GEN1Q17RS7 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
GEN1Q17RS7 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
GEN1Q17RS7 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
GEN1Q17RS7 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
GEN1Q17RS7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GEN1Q17RS7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GEN1Q17RS7 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
GEN1Q17RS7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
GEN1Q17RS7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GEN1Q17RS7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GEN1Q17RS7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
GEN1Q17RS7 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
GEN1Q17RS7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
GEN1Q17RS7 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GEN1Q17RS7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
GEN1Q17RS7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GEN1Q17RS7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
GEN1Q17RS7 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
GEN1Q17RS7 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GEN1Q17RS7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
GEN1Q17RS7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
GEN1Q17RS7 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
GEN1Q17RS7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
GEN1Q17RS7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
GEN1Q17RS7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
GEN1Q17RS7 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
GEN1Q17RS7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GEN1Q17RS7 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GEN1Q17RS7 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
GEN1Q17RS7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
GEN1Q17RS7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
GEN1Q17RS7 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
GEN1Q17RS7 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GEN1Q17RS7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
GEN1Q17RS7 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
GEN1Q17RS7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GEN1Q17RS7 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GEN1Q17RS7 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
GEN1Q17RS7 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
GEN1Q17RS7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
GEN1Q17RS7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GEN1Q17RS7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
GEN1Q17RS7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
GEN1Q17RS7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
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