Protein–RNA interactions for Protein: Q17RB8

LONRF1, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 1, humanhuman

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Length 773 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LONRF1Q17RB8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
LONRF1Q17RB8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LONRF1Q17RB8 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LONRF1Q17RB8 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LONRF1Q17RB8 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LONRF1Q17RB8 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LONRF1Q17RB8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LONRF1Q17RB8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LONRF1Q17RB8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LONRF1Q17RB8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LONRF1Q17RB8 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LONRF1Q17RB8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LONRF1Q17RB8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LONRF1Q17RB8 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LONRF1Q17RB8 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LONRF1Q17RB8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LONRF1Q17RB8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
LONRF1Q17RB8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LONRF1Q17RB8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LONRF1Q17RB8 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LONRF1Q17RB8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LONRF1Q17RB8 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LONRF1Q17RB8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LONRF1Q17RB8 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LONRF1Q17RB8 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LONRF1Q17RB8 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LONRF1Q17RB8 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LONRF1Q17RB8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LONRF1Q17RB8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LONRF1Q17RB8 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LONRF1Q17RB8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LONRF1Q17RB8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LONRF1Q17RB8 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LONRF1Q17RB8 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
LONRF1Q17RB8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LONRF1Q17RB8 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
LONRF1Q17RB8 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
LONRF1Q17RB8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LONRF1Q17RB8 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
LONRF1Q17RB8 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
LONRF1Q17RB8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LONRF1Q17RB8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
LONRF1Q17RB8 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LONRF1Q17RB8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LONRF1Q17RB8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LONRF1Q17RB8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
LONRF1Q17RB8 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
LONRF1Q17RB8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LONRF1Q17RB8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LONRF1Q17RB8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LONRF1Q17RB8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
LONRF1Q17RB8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
LONRF1Q17RB8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LONRF1Q17RB8 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
LONRF1Q17RB8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LONRF1Q17RB8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
LONRF1Q17RB8 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
LONRF1Q17RB8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LONRF1Q17RB8 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LONRF1Q17RB8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LONRF1Q17RB8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
LONRF1Q17RB8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
LONRF1Q17RB8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LONRF1Q17RB8 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LONRF1Q17RB8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
LONRF1Q17RB8 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
LONRF1Q17RB8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
LONRF1Q17RB8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
LONRF1Q17RB8 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
LONRF1Q17RB8 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
LONRF1Q17RB8 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LONRF1Q17RB8 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LONRF1Q17RB8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
LONRF1Q17RB8 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
LONRF1Q17RB8 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
LONRF1Q17RB8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
LONRF1Q17RB8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LONRF1Q17RB8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
LONRF1Q17RB8 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
LONRF1Q17RB8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
LONRF1Q17RB8 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LONRF1Q17RB8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
LONRF1Q17RB8 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
LONRF1Q17RB8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
LONRF1Q17RB8 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
LONRF1Q17RB8 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
LONRF1Q17RB8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
LONRF1Q17RB8 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
LONRF1Q17RB8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
LONRF1Q17RB8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
LONRF1Q17RB8 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LONRF1Q17RB8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
LONRF1Q17RB8 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
LONRF1Q17RB8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
LONRF1Q17RB8 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LONRF1Q17RB8 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
LONRF1Q17RB8 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
LONRF1Q17RB8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
LONRF1Q17RB8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
LONRF1Q17RB8 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
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