Protein–RNA interactions for Protein: Q16650

TBR1, T-box brain protein 1, humanhuman

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Length 682 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TBR1Q16650 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TBR1Q16650 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TBR1Q16650 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TBR1Q16650 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TBR1Q16650 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TBR1Q16650 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TBR1Q16650 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TBR1Q16650 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TBR1Q16650 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TBR1Q16650 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TBR1Q16650 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TBR1Q16650 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TBR1Q16650 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TBR1Q16650 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TBR1Q16650 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TBR1Q16650 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TBR1Q16650 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TBR1Q16650 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TBR1Q16650 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TBR1Q16650 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TBR1Q16650 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TBR1Q16650 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TBR1Q16650 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TBR1Q16650 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TBR1Q16650 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TBR1Q16650 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TBR1Q16650 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TBR1Q16650 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TBR1Q16650 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TBR1Q16650 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TBR1Q16650 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TBR1Q16650 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TBR1Q16650 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TBR1Q16650 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TBR1Q16650 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TBR1Q16650 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TBR1Q16650 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TBR1Q16650 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TBR1Q16650 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TBR1Q16650 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TBR1Q16650 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TBR1Q16650 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TBR1Q16650 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TBR1Q16650 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TBR1Q16650 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TBR1Q16650 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TBR1Q16650 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TBR1Q16650 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TBR1Q16650 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TBR1Q16650 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TBR1Q16650 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TBR1Q16650 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TBR1Q16650 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TBR1Q16650 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TBR1Q16650 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TBR1Q16650 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TBR1Q16650 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TBR1Q16650 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TBR1Q16650 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TBR1Q16650 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TBR1Q16650 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TBR1Q16650 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TBR1Q16650 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TBR1Q16650 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBR1Q16650 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBR1Q16650 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TBR1Q16650 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TBR1Q16650 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
TBR1Q16650 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TBR1Q16650 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TBR1Q16650 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TBR1Q16650 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TBR1Q16650 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TBR1Q16650 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TBR1Q16650 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TBR1Q16650 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TBR1Q16650 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
TBR1Q16650 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TBR1Q16650 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
TBR1Q16650 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TBR1Q16650 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TBR1Q16650 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TBR1Q16650 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
TBR1Q16650 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TBR1Q16650 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
TBR1Q16650 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TBR1Q16650 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TBR1Q16650 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TBR1Q16650 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TBR1Q16650 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TBR1Q16650 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TBR1Q16650 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TBR1Q16650 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TBR1Q16650 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TBR1Q16650 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TBR1Q16650 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TBR1Q16650 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TBR1Q16650 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TBR1Q16650 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TBR1Q16650 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
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