Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NTRK2Q16620 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
NTRK2Q16620 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
NTRK2Q16620 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
NTRK2Q16620 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
NTRK2Q16620 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NTRK2Q16620 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NTRK2Q16620 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
NTRK2Q16620 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
NTRK2Q16620 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
NTRK2Q16620 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
NTRK2Q16620 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NTRK2Q16620 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NTRK2Q16620 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NTRK2Q16620 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NTRK2Q16620 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NTRK2Q16620 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NTRK2Q16620 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NTRK2Q16620 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NTRK2Q16620 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NTRK2Q16620 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NTRK2Q16620 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NTRK2Q16620 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NTRK2Q16620 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NTRK2Q16620 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NTRK2Q16620 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NTRK2Q16620 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NTRK2Q16620 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NTRK2Q16620 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NTRK2Q16620 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
NTRK2Q16620 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
NTRK2Q16620 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NTRK2Q16620 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NTRK2Q16620 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NTRK2Q16620 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NTRK2Q16620 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NTRK2Q16620 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NTRK2Q16620 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTRK2Q16620 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTRK2Q16620 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTRK2Q16620 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
NTRK2Q16620 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NTRK2Q16620 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NTRK2Q16620 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NTRK2Q16620 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NTRK2Q16620 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NTRK2Q16620 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTRK2Q16620 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTRK2Q16620 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTRK2Q16620 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTRK2Q16620 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTRK2Q16620 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NTRK2Q16620 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NTRK2Q16620 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NTRK2Q16620 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NTRK2Q16620 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NTRK2Q16620 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NTRK2Q16620 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NTRK2Q16620 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NTRK2Q16620 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NTRK2Q16620 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NTRK2Q16620 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NTRK2Q16620 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NTRK2Q16620 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NTRK2Q16620 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NTRK2Q16620 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NTRK2Q16620 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NTRK2Q16620 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NTRK2Q16620 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NTRK2Q16620 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
NTRK2Q16620 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NTRK2Q16620 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NTRK2Q16620 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NTRK2Q16620 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NTRK2Q16620 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NTRK2Q16620 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NTRK2Q16620 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NTRK2Q16620 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NTRK2Q16620 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NTRK2Q16620 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NTRK2Q16620 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NTRK2Q16620 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NTRK2Q16620 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NTRK2Q16620 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NTRK2Q16620 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NTRK2Q16620 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NTRK2Q16620 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NTRK2Q16620 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NTRK2Q16620 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NTRK2Q16620 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NTRK2Q16620 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NTRK2Q16620 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
NTRK2Q16620 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NTRK2Q16620 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NTRK2Q16620 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NTRK2Q16620 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NTRK2Q16620 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NTRK2Q16620 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NTRK2Q16620 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NTRK2Q16620 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
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