Protein–RNA interactions for Protein: Q16553

LY6E, Lymphocyte antigen 6E, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LY6EQ16553 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LY6EQ16553 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LY6EQ16553 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
LY6EQ16553 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LY6EQ16553 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
LY6EQ16553 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
LY6EQ16553 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LY6EQ16553 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LY6EQ16553 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LY6EQ16553 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LY6EQ16553 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LY6EQ16553 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LY6EQ16553 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LY6EQ16553 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
LY6EQ16553 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LY6EQ16553 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LY6EQ16553 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LY6EQ16553 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LY6EQ16553 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
LY6EQ16553 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LY6EQ16553 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LY6EQ16553 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LY6EQ16553 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
LY6EQ16553 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
LY6EQ16553 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
LY6EQ16553 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LY6EQ16553 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LY6EQ16553 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LY6EQ16553 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LY6EQ16553 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LY6EQ16553 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
LY6EQ16553 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LY6EQ16553 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LY6EQ16553 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LY6EQ16553 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
LY6EQ16553 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LY6EQ16553 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LY6EQ16553 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LY6EQ16553 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
LY6EQ16553 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
LY6EQ16553 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
LY6EQ16553 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LY6EQ16553 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
LY6EQ16553 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LY6EQ16553 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LY6EQ16553 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LY6EQ16553 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
LY6EQ16553 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.28■■□□□ 1
LY6EQ16553 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
LY6EQ16553 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LY6EQ16553 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.27■■□□□ 1
LY6EQ16553 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LY6EQ16553 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
LY6EQ16553 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LY6EQ16553 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LY6EQ16553 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LY6EQ16553 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LY6EQ16553 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LY6EQ16553 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LY6EQ16553 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LY6EQ16553 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LY6EQ16553 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LY6EQ16553 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LY6EQ16553 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LY6EQ16553 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LY6EQ16553 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LY6EQ16553 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LY6EQ16553 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LY6EQ16553 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LY6EQ16553 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LY6EQ16553 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LY6EQ16553 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LY6EQ16553 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LY6EQ16553 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LY6EQ16553 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LY6EQ16553 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LY6EQ16553 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
LY6EQ16553 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LY6EQ16553 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LY6EQ16553 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LY6EQ16553 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LY6EQ16553 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LY6EQ16553 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
LY6EQ16553 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LY6EQ16553 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LY6EQ16553 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LY6EQ16553 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
LY6EQ16553 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LY6EQ16553 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
LY6EQ16553 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LY6EQ16553 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LY6EQ16553 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LY6EQ16553 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
LY6EQ16553 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LY6EQ16553 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LY6EQ16553 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
LY6EQ16553 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LY6EQ16553 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LY6EQ16553 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LY6EQ16553 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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