Protein–RNA interactions for Protein: Q15915

ZIC1, Zinc finger protein ZIC 1, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZIC1Q15915 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZIC1Q15915 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZIC1Q15915 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ZIC1Q15915 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZIC1Q15915 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZIC1Q15915 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
ZIC1Q15915 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZIC1Q15915 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
ZIC1Q15915 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZIC1Q15915 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZIC1Q15915 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
ZIC1Q15915 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZIC1Q15915 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZIC1Q15915 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
ZIC1Q15915 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
ZIC1Q15915 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZIC1Q15915 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZIC1Q15915 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZIC1Q15915 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZIC1Q15915 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
ZIC1Q15915 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZIC1Q15915 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZIC1Q15915 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZIC1Q15915 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
ZIC1Q15915 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
ZIC1Q15915 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZIC1Q15915 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZIC1Q15915 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZIC1Q15915 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
ZIC1Q15915 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZIC1Q15915 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
ZIC1Q15915 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZIC1Q15915 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
ZIC1Q15915 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZIC1Q15915 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZIC1Q15915 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZIC1Q15915 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
ZIC1Q15915 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZIC1Q15915 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
ZIC1Q15915 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZIC1Q15915 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
ZIC1Q15915 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZIC1Q15915 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZIC1Q15915 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
ZIC1Q15915 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZIC1Q15915 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
ZIC1Q15915 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ZIC1Q15915 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZIC1Q15915 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZIC1Q15915 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZIC1Q15915 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZIC1Q15915 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZIC1Q15915 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZIC1Q15915 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZIC1Q15915 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZIC1Q15915 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZIC1Q15915 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZIC1Q15915 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZIC1Q15915 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZIC1Q15915 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZIC1Q15915 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
ZIC1Q15915 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZIC1Q15915 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZIC1Q15915 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZIC1Q15915 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZIC1Q15915 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZIC1Q15915 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZIC1Q15915 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZIC1Q15915 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ZIC1Q15915 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZIC1Q15915 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZIC1Q15915 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZIC1Q15915 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZIC1Q15915 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZIC1Q15915 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZIC1Q15915 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZIC1Q15915 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZIC1Q15915 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZIC1Q15915 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZIC1Q15915 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZIC1Q15915 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZIC1Q15915 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZIC1Q15915 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZIC1Q15915 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZIC1Q15915 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZIC1Q15915 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZIC1Q15915 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZIC1Q15915 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZIC1Q15915 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZIC1Q15915 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZIC1Q15915 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZIC1Q15915 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZIC1Q15915 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZIC1Q15915 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZIC1Q15915 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZIC1Q15915 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZIC1Q15915 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZIC1Q15915 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZIC1Q15915 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZIC1Q15915 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms