Protein–RNA interactions for Protein: Q15836

VAMP3, Vesicle-associated membrane protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP3Q15836 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAMP3Q15836 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAMP3Q15836 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VAMP3Q15836 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAMP3Q15836 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAMP3Q15836 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VAMP3Q15836 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VAMP3Q15836 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VAMP3Q15836 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
VAMP3Q15836 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAMP3Q15836 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAMP3Q15836 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
VAMP3Q15836 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
VAMP3Q15836 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAMP3Q15836 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAMP3Q15836 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
VAMP3Q15836 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP3Q15836 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP3Q15836 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP3Q15836 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP3Q15836 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP3Q15836 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP3Q15836 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP3Q15836 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
VAMP3Q15836 ARHGAP5-203ENST00000396582 5786 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP3Q15836 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP3Q15836 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP3Q15836 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
VAMP3Q15836 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
VAMP3Q15836 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAMP3Q15836 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAMP3Q15836 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAMP3Q15836 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAMP3Q15836 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
VAMP3Q15836 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAMP3Q15836 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAMP3Q15836 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAMP3Q15836 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAMP3Q15836 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
VAMP3Q15836 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAMP3Q15836 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
VAMP3Q15836 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP3Q15836 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP3Q15836 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP3Q15836 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP3Q15836 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
VAMP3Q15836 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAMP3Q15836 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAMP3Q15836 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAMP3Q15836 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
VAMP3Q15836 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAMP3Q15836 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAMP3Q15836 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAMP3Q15836 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAMP3Q15836 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
VAMP3Q15836 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAMP3Q15836 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
VAMP3Q15836 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAMP3Q15836 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAMP3Q15836 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
VAMP3Q15836 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAMP3Q15836 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
VAMP3Q15836 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAMP3Q15836 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAMP3Q15836 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAMP3Q15836 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAMP3Q15836 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAMP3Q15836 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAMP3Q15836 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
VAMP3Q15836 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAMP3Q15836 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAMP3Q15836 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAMP3Q15836 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
VAMP3Q15836 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAMP3Q15836 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAMP3Q15836 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAMP3Q15836 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAMP3Q15836 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAMP3Q15836 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
VAMP3Q15836 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
VAMP3Q15836 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAMP3Q15836 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAMP3Q15836 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAMP3Q15836 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAMP3Q15836 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
VAMP3Q15836 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAMP3Q15836 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
VAMP3Q15836 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
VAMP3Q15836 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAMP3Q15836 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAMP3Q15836 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAMP3Q15836 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAMP3Q15836 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
VAMP3Q15836 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAMP3Q15836 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAMP3Q15836 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
VAMP3Q15836 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
VAMP3Q15836 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
VAMP3Q15836 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
VAMP3Q15836 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
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