Protein–RNA interactions for Protein: Q15652

JMJD1C, Probable JmjC domain-containing histone demethylation protein 2C, humanhuman

Predictions only

Length 2,540 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JMJD1CQ15652 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
JMJD1CQ15652 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
JMJD1CQ15652 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
JMJD1CQ15652 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
JMJD1CQ15652 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
JMJD1CQ15652 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
JMJD1CQ15652 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
JMJD1CQ15652 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
JMJD1CQ15652 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
JMJD1CQ15652 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
JMJD1CQ15652 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
JMJD1CQ15652 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
JMJD1CQ15652 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
JMJD1CQ15652 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
JMJD1CQ15652 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
JMJD1CQ15652 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
JMJD1CQ15652 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
JMJD1CQ15652 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
JMJD1CQ15652 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
JMJD1CQ15652 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
JMJD1CQ15652 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
JMJD1CQ15652 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
JMJD1CQ15652 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
JMJD1CQ15652 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
JMJD1CQ15652 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
JMJD1CQ15652 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
JMJD1CQ15652 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
JMJD1CQ15652 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
JMJD1CQ15652 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
JMJD1CQ15652 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
JMJD1CQ15652 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
JMJD1CQ15652 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
JMJD1CQ15652 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
JMJD1CQ15652 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
JMJD1CQ15652 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
JMJD1CQ15652 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
JMJD1CQ15652 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
JMJD1CQ15652 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
JMJD1CQ15652 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
JMJD1CQ15652 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
JMJD1CQ15652 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
JMJD1CQ15652 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
JMJD1CQ15652 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
JMJD1CQ15652 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
JMJD1CQ15652 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
JMJD1CQ15652 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
JMJD1CQ15652 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
JMJD1CQ15652 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
JMJD1CQ15652 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
JMJD1CQ15652 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
JMJD1CQ15652 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
JMJD1CQ15652 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
JMJD1CQ15652 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
JMJD1CQ15652 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
JMJD1CQ15652 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
JMJD1CQ15652 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
JMJD1CQ15652 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
JMJD1CQ15652 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
JMJD1CQ15652 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
JMJD1CQ15652 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
JMJD1CQ15652 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
JMJD1CQ15652 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
JMJD1CQ15652 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
JMJD1CQ15652 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
JMJD1CQ15652 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
JMJD1CQ15652 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
JMJD1CQ15652 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
JMJD1CQ15652 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
JMJD1CQ15652 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
JMJD1CQ15652 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
JMJD1CQ15652 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
JMJD1CQ15652 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
JMJD1CQ15652 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
JMJD1CQ15652 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
JMJD1CQ15652 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
JMJD1CQ15652 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
JMJD1CQ15652 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
JMJD1CQ15652 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
JMJD1CQ15652 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
JMJD1CQ15652 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
JMJD1CQ15652 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
JMJD1CQ15652 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
JMJD1CQ15652 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
JMJD1CQ15652 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
JMJD1CQ15652 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
JMJD1CQ15652 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
JMJD1CQ15652 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
JMJD1CQ15652 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
JMJD1CQ15652 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
JMJD1CQ15652 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
JMJD1CQ15652 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
JMJD1CQ15652 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
JMJD1CQ15652 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
JMJD1CQ15652 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
JMJD1CQ15652 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
JMJD1CQ15652 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.66■■□□□ 1.06
JMJD1CQ15652 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
JMJD1CQ15652 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
JMJD1CQ15652 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
JMJD1CQ15652 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms