Protein–RNA interactions for Protein: Q15560

TCEA2, Transcription elongation factor A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCEA2Q15560 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TCEA2Q15560 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCEA2Q15560 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCEA2Q15560 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCEA2Q15560 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TCEA2Q15560 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCEA2Q15560 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCEA2Q15560 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
TCEA2Q15560 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
TCEA2Q15560 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
TCEA2Q15560 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCEA2Q15560 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCEA2Q15560 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCEA2Q15560 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
TCEA2Q15560 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCEA2Q15560 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCEA2Q15560 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCEA2Q15560 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
TCEA2Q15560 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCEA2Q15560 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCEA2Q15560 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
TCEA2Q15560 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
TCEA2Q15560 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
TCEA2Q15560 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCEA2Q15560 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCEA2Q15560 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
TCEA2Q15560 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
TCEA2Q15560 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
TCEA2Q15560 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TCEA2Q15560 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
TCEA2Q15560 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
TCEA2Q15560 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
TCEA2Q15560 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCEA2Q15560 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
TCEA2Q15560 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCEA2Q15560 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCEA2Q15560 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCEA2Q15560 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
TCEA2Q15560 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
TCEA2Q15560 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
TCEA2Q15560 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCEA2Q15560 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
TCEA2Q15560 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCEA2Q15560 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
TCEA2Q15560 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
TCEA2Q15560 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
TCEA2Q15560 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCEA2Q15560 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
TCEA2Q15560 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCEA2Q15560 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCEA2Q15560 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
TCEA2Q15560 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCEA2Q15560 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
TCEA2Q15560 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCEA2Q15560 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCEA2Q15560 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
TCEA2Q15560 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCEA2Q15560 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCEA2Q15560 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCEA2Q15560 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
TCEA2Q15560 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCEA2Q15560 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCEA2Q15560 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCEA2Q15560 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCEA2Q15560 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCEA2Q15560 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
TCEA2Q15560 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
TCEA2Q15560 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCEA2Q15560 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCEA2Q15560 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCEA2Q15560 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCEA2Q15560 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
TCEA2Q15560 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCEA2Q15560 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
TCEA2Q15560 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCEA2Q15560 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCEA2Q15560 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCEA2Q15560 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCEA2Q15560 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
TCEA2Q15560 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCEA2Q15560 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCEA2Q15560 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCEA2Q15560 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TCEA2Q15560 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCEA2Q15560 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCEA2Q15560 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCEA2Q15560 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TCEA2Q15560 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TCEA2Q15560 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TCEA2Q15560 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TCEA2Q15560 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TCEA2Q15560 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
TCEA2Q15560 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TCEA2Q15560 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
TCEA2Q15560 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TCEA2Q15560 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TCEA2Q15560 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TCEA2Q15560 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TCEA2Q15560 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
TCEA2Q15560 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.7 ms