Protein–RNA interactions for Protein: Q15418

RPS6KA1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 735 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KA1Q15418 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RPS6KA1Q15418 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RPS6KA1Q15418 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPS6KA1Q15418 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
RPS6KA1Q15418 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
RPS6KA1Q15418 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPS6KA1Q15418 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
RPS6KA1Q15418 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPS6KA1Q15418 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RPS6KA1Q15418 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
RPS6KA1Q15418 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
RPS6KA1Q15418 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPS6KA1Q15418 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPS6KA1Q15418 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPS6KA1Q15418 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
RPS6KA1Q15418 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
RPS6KA1Q15418 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPS6KA1Q15418 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RPS6KA1Q15418 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
RPS6KA1Q15418 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPS6KA1Q15418 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPS6KA1Q15418 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
RPS6KA1Q15418 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPS6KA1Q15418 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
RPS6KA1Q15418 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RPS6KA1Q15418 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPS6KA1Q15418 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPS6KA1Q15418 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
RPS6KA1Q15418 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPS6KA1Q15418 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RPS6KA1Q15418 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPS6KA1Q15418 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
RPS6KA1Q15418 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPS6KA1Q15418 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPS6KA1Q15418 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPS6KA1Q15418 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RPS6KA1Q15418 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPS6KA1Q15418 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RPS6KA1Q15418 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RPS6KA1Q15418 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPS6KA1Q15418 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPS6KA1Q15418 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RPS6KA1Q15418 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPS6KA1Q15418 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPS6KA1Q15418 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
RPS6KA1Q15418 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6KA1Q15418 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6KA1Q15418 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6KA1Q15418 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RPS6KA1Q15418 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RPS6KA1Q15418 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RPS6KA1Q15418 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPS6KA1Q15418 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RPS6KA1Q15418 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPS6KA1Q15418 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RPS6KA1Q15418 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPS6KA1Q15418 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPS6KA1Q15418 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RPS6KA1Q15418 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPS6KA1Q15418 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RPS6KA1Q15418 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RPS6KA1Q15418 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RPS6KA1Q15418 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RPS6KA1Q15418 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPS6KA1Q15418 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPS6KA1Q15418 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RPS6KA1Q15418 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6KA1Q15418 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RPS6KA1Q15418 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6KA1Q15418 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6KA1Q15418 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6KA1Q15418 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6KA1Q15418 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RPS6KA1Q15418 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPS6KA1Q15418 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RPS6KA1Q15418 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPS6KA1Q15418 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RPS6KA1Q15418 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RPS6KA1Q15418 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6KA1Q15418 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6KA1Q15418 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6KA1Q15418 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RPS6KA1Q15418 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPS6KA1Q15418 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPS6KA1Q15418 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPS6KA1Q15418 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPS6KA1Q15418 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPS6KA1Q15418 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RPS6KA1Q15418 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPS6KA1Q15418 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RPS6KA1Q15418 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPS6KA1Q15418 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RPS6KA1Q15418 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPS6KA1Q15418 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPS6KA1Q15418 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPS6KA1Q15418 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPS6KA1Q15418 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RPS6KA1Q15418 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPS6KA1Q15418 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RPS6KA1Q15418 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms