Protein–RNA interactions for Protein: Q15181

PPA1, Inorganic pyrophosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPA1Q15181 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPA1Q15181 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPA1Q15181 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PPA1Q15181 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PPA1Q15181 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPA1Q15181 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PPA1Q15181 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPA1Q15181 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPA1Q15181 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPA1Q15181 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PPA1Q15181 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPA1Q15181 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPA1Q15181 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPA1Q15181 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PPA1Q15181 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PPA1Q15181 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPA1Q15181 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPA1Q15181 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPA1Q15181 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PPA1Q15181 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPA1Q15181 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPA1Q15181 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPA1Q15181 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPA1Q15181 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPA1Q15181 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PPA1Q15181 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPA1Q15181 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPA1Q15181 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PPA1Q15181 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPA1Q15181 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPA1Q15181 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PPA1Q15181 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PPA1Q15181 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
PPA1Q15181 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PPA1Q15181 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PPA1Q15181 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPA1Q15181 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PPA1Q15181 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPA1Q15181 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PPA1Q15181 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPA1Q15181 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPA1Q15181 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPA1Q15181 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PPA1Q15181 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PPA1Q15181 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PPA1Q15181 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPA1Q15181 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PPA1Q15181 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPA1Q15181 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPA1Q15181 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPA1Q15181 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PPA1Q15181 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPA1Q15181 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PPA1Q15181 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPA1Q15181 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPA1Q15181 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPA1Q15181 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PPA1Q15181 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPA1Q15181 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPA1Q15181 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
PPA1Q15181 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPA1Q15181 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPA1Q15181 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
PPA1Q15181 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
PPA1Q15181 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PPA1Q15181 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPA1Q15181 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PPA1Q15181 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPA1Q15181 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPA1Q15181 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
PPA1Q15181 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPA1Q15181 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPA1Q15181 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PPA1Q15181 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPA1Q15181 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PPA1Q15181 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPA1Q15181 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPA1Q15181 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PPA1Q15181 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPA1Q15181 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPA1Q15181 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPA1Q15181 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PPA1Q15181 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPA1Q15181 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPA1Q15181 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPA1Q15181 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPA1Q15181 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPA1Q15181 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PPA1Q15181 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPA1Q15181 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PPA1Q15181 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPA1Q15181 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPA1Q15181 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPA1Q15181 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PPA1Q15181 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPA1Q15181 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPA1Q15181 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPA1Q15181 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPA1Q15181 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PPA1Q15181 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms