Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PCOLCEQ15113 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCOLCEQ15113 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCOLCEQ15113 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCOLCEQ15113 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PCOLCEQ15113 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCOLCEQ15113 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCOLCEQ15113 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PCOLCEQ15113 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCOLCEQ15113 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCOLCEQ15113 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
PCOLCEQ15113 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCOLCEQ15113 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
PCOLCEQ15113 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCOLCEQ15113 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PCOLCEQ15113 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCOLCEQ15113 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PCOLCEQ15113 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCOLCEQ15113 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
PCOLCEQ15113 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCOLCEQ15113 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
PCOLCEQ15113 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCOLCEQ15113 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCOLCEQ15113 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCOLCEQ15113 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PCOLCEQ15113 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
PCOLCEQ15113 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCOLCEQ15113 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCOLCEQ15113 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PCOLCEQ15113 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCOLCEQ15113 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PCOLCEQ15113 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCOLCEQ15113 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCOLCEQ15113 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCOLCEQ15113 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PCOLCEQ15113 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PCOLCEQ15113 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PCOLCEQ15113 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCOLCEQ15113 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCOLCEQ15113 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCOLCEQ15113 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCOLCEQ15113 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCOLCEQ15113 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PCOLCEQ15113 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCOLCEQ15113 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCOLCEQ15113 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCOLCEQ15113 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCOLCEQ15113 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PCOLCEQ15113 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCOLCEQ15113 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCOLCEQ15113 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PCOLCEQ15113 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCOLCEQ15113 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PCOLCEQ15113 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCOLCEQ15113 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCOLCEQ15113 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PCOLCEQ15113 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PCOLCEQ15113 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCOLCEQ15113 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PCOLCEQ15113 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PCOLCEQ15113 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCOLCEQ15113 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCOLCEQ15113 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCOLCEQ15113 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCOLCEQ15113 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PCOLCEQ15113 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCOLCEQ15113 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCOLCEQ15113 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PCOLCEQ15113 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCOLCEQ15113 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCOLCEQ15113 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PCOLCEQ15113 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PCOLCEQ15113 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCOLCEQ15113 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PCOLCEQ15113 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCOLCEQ15113 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCOLCEQ15113 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCOLCEQ15113 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
PCOLCEQ15113 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCOLCEQ15113 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCOLCEQ15113 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCOLCEQ15113 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
PCOLCEQ15113 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCOLCEQ15113 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCOLCEQ15113 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PCOLCEQ15113 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCOLCEQ15113 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCOLCEQ15113 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCOLCEQ15113 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PCOLCEQ15113 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCOLCEQ15113 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCOLCEQ15113 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCOLCEQ15113 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCOLCEQ15113 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PCOLCEQ15113 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PCOLCEQ15113 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCOLCEQ15113 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PCOLCEQ15113 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCOLCEQ15113 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PCOLCEQ15113 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
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