Protein–RNA interactions for Protein: Q15032

R3HDM1, R3H domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,099 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
R3HDM1Q15032 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.17■■■■□ 3.22
R3HDM1Q15032 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC35.17■■■■□ 3.22
R3HDM1Q15032 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
R3HDM1Q15032 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
R3HDM1Q15032 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
R3HDM1Q15032 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC35.16■■■■□ 3.22
R3HDM1Q15032 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
R3HDM1Q15032 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
R3HDM1Q15032 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.12■■■■□ 3.21
R3HDM1Q15032 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
R3HDM1Q15032 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
R3HDM1Q15032 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
R3HDM1Q15032 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
R3HDM1Q15032 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
R3HDM1Q15032 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
R3HDM1Q15032 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
R3HDM1Q15032 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
R3HDM1Q15032 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
R3HDM1Q15032 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
R3HDM1Q15032 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
R3HDM1Q15032 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
R3HDM1Q15032 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
R3HDM1Q15032 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
R3HDM1Q15032 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
R3HDM1Q15032 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
R3HDM1Q15032 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
R3HDM1Q15032 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC35■■■■□ 3.19
R3HDM1Q15032 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
R3HDM1Q15032 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
R3HDM1Q15032 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
R3HDM1Q15032 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
R3HDM1Q15032 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.97■■■■□ 3.19
R3HDM1Q15032 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
R3HDM1Q15032 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC34.97■■■■□ 3.19
R3HDM1Q15032 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
R3HDM1Q15032 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
R3HDM1Q15032 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC34.95■■■■□ 3.19
R3HDM1Q15032 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
R3HDM1Q15032 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
R3HDM1Q15032 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
R3HDM1Q15032 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
R3HDM1Q15032 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
R3HDM1Q15032 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
R3HDM1Q15032 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
R3HDM1Q15032 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
R3HDM1Q15032 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
R3HDM1Q15032 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
R3HDM1Q15032 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
R3HDM1Q15032 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
R3HDM1Q15032 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
R3HDM1Q15032 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
R3HDM1Q15032 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
R3HDM1Q15032 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC34.9■■■■□ 3.18
R3HDM1Q15032 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
R3HDM1Q15032 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
R3HDM1Q15032 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
R3HDM1Q15032 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
R3HDM1Q15032 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
R3HDM1Q15032 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
R3HDM1Q15032 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
R3HDM1Q15032 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
R3HDM1Q15032 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
R3HDM1Q15032 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
R3HDM1Q15032 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
R3HDM1Q15032 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
R3HDM1Q15032 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
R3HDM1Q15032 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
R3HDM1Q15032 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
R3HDM1Q15032 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
R3HDM1Q15032 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
R3HDM1Q15032 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
R3HDM1Q15032 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
R3HDM1Q15032 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
R3HDM1Q15032 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.84■■■■□ 3.17
R3HDM1Q15032 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
R3HDM1Q15032 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
R3HDM1Q15032 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
R3HDM1Q15032 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC34.82■■■■□ 3.16
R3HDM1Q15032 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
R3HDM1Q15032 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
R3HDM1Q15032 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
R3HDM1Q15032 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
R3HDM1Q15032 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
R3HDM1Q15032 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
R3HDM1Q15032 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
R3HDM1Q15032 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
R3HDM1Q15032 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
R3HDM1Q15032 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
R3HDM1Q15032 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
R3HDM1Q15032 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
R3HDM1Q15032 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
R3HDM1Q15032 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
R3HDM1Q15032 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC34.71■■■■□ 3.15
R3HDM1Q15032 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
R3HDM1Q15032 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
R3HDM1Q15032 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
R3HDM1Q15032 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
R3HDM1Q15032 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
R3HDM1Q15032 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
R3HDM1Q15032 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.68■■■■□ 3.14
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