Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCLAFQ15004 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCLAFQ15004 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PCLAFQ15004 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PCLAFQ15004 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PCLAFQ15004 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCLAFQ15004 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCLAFQ15004 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCLAFQ15004 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCLAFQ15004 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
PCLAFQ15004 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCLAFQ15004 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
PCLAFQ15004 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCLAFQ15004 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
PCLAFQ15004 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCLAFQ15004 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
PCLAFQ15004 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCLAFQ15004 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCLAFQ15004 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCLAFQ15004 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
PCLAFQ15004 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCLAFQ15004 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCLAFQ15004 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
PCLAFQ15004 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCLAFQ15004 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCLAFQ15004 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
PCLAFQ15004 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCLAFQ15004 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCLAFQ15004 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCLAFQ15004 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
PCLAFQ15004 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCLAFQ15004 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
PCLAFQ15004 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PCLAFQ15004 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
PCLAFQ15004 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
PCLAFQ15004 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PCLAFQ15004 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PCLAFQ15004 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCLAFQ15004 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCLAFQ15004 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PCLAFQ15004 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCLAFQ15004 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PCLAFQ15004 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PCLAFQ15004 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCLAFQ15004 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PCLAFQ15004 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCLAFQ15004 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PCLAFQ15004 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PCLAFQ15004 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCLAFQ15004 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PCLAFQ15004 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PCLAFQ15004 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCLAFQ15004 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCLAFQ15004 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PCLAFQ15004 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCLAFQ15004 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCLAFQ15004 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PCLAFQ15004 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCLAFQ15004 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCLAFQ15004 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCLAFQ15004 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PCLAFQ15004 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PCLAFQ15004 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCLAFQ15004 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PCLAFQ15004 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCLAFQ15004 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCLAFQ15004 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCLAFQ15004 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PCLAFQ15004 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCLAFQ15004 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCLAFQ15004 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCLAFQ15004 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PCLAFQ15004 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCLAFQ15004 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PCLAFQ15004 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCLAFQ15004 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PCLAFQ15004 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCLAFQ15004 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PCLAFQ15004 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PCLAFQ15004 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PCLAFQ15004 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCLAFQ15004 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCLAFQ15004 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCLAFQ15004 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PCLAFQ15004 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
PCLAFQ15004 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCLAFQ15004 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PCLAFQ15004 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
PCLAFQ15004 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PCLAFQ15004 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PCLAFQ15004 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PCLAFQ15004 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCLAFQ15004 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCLAFQ15004 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCLAFQ15004 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PCLAFQ15004 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCLAFQ15004 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCLAFQ15004 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCLAFQ15004 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PCLAFQ15004 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
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