Protein–RNA interactions for Protein: Q14156

EFR3A, Protein EFR3 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFR3AQ14156 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
EFR3AQ14156 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
EFR3AQ14156 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EFR3AQ14156 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EFR3AQ14156 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EFR3AQ14156 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EFR3AQ14156 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EFR3AQ14156 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
EFR3AQ14156 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
EFR3AQ14156 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
EFR3AQ14156 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
EFR3AQ14156 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
EFR3AQ14156 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFR3AQ14156 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFR3AQ14156 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFR3AQ14156 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
EFR3AQ14156 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EFR3AQ14156 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EFR3AQ14156 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
EFR3AQ14156 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
EFR3AQ14156 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
EFR3AQ14156 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFR3AQ14156 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
EFR3AQ14156 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
EFR3AQ14156 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFR3AQ14156 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFR3AQ14156 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFR3AQ14156 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFR3AQ14156 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFR3AQ14156 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFR3AQ14156 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
EFR3AQ14156 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFR3AQ14156 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
EFR3AQ14156 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFR3AQ14156 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFR3AQ14156 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFR3AQ14156 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFR3AQ14156 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
EFR3AQ14156 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFR3AQ14156 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
EFR3AQ14156 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
EFR3AQ14156 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFR3AQ14156 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
EFR3AQ14156 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFR3AQ14156 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
EFR3AQ14156 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFR3AQ14156 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
EFR3AQ14156 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
EFR3AQ14156 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EFR3AQ14156 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
EFR3AQ14156 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFR3AQ14156 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFR3AQ14156 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFR3AQ14156 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFR3AQ14156 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFR3AQ14156 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
EFR3AQ14156 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFR3AQ14156 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
EFR3AQ14156 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
EFR3AQ14156 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
EFR3AQ14156 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFR3AQ14156 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
EFR3AQ14156 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
EFR3AQ14156 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
EFR3AQ14156 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFR3AQ14156 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFR3AQ14156 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
EFR3AQ14156 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
EFR3AQ14156 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFR3AQ14156 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFR3AQ14156 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFR3AQ14156 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
EFR3AQ14156 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
EFR3AQ14156 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
EFR3AQ14156 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFR3AQ14156 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFR3AQ14156 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EFR3AQ14156 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFR3AQ14156 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFR3AQ14156 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFR3AQ14156 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EFR3AQ14156 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EFR3AQ14156 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EFR3AQ14156 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFR3AQ14156 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFR3AQ14156 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
EFR3AQ14156 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EFR3AQ14156 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFR3AQ14156 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFR3AQ14156 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFR3AQ14156 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EFR3AQ14156 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFR3AQ14156 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFR3AQ14156 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EFR3AQ14156 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EFR3AQ14156 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EFR3AQ14156 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
EFR3AQ14156 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EFR3AQ14156 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EFR3AQ14156 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms