Protein–RNA interactions for Protein: Q13951

CBFB, Core-binding factor subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBFBQ13951 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBFBQ13951 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBFBQ13951 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CBFBQ13951 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CBFBQ13951 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CBFBQ13951 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBFBQ13951 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CBFBQ13951 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBFBQ13951 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBFBQ13951 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CBFBQ13951 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBFBQ13951 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBFBQ13951 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CBFBQ13951 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBFBQ13951 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBFBQ13951 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CBFBQ13951 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBFBQ13951 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CBFBQ13951 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBFBQ13951 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBFBQ13951 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBFBQ13951 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CBFBQ13951 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBFBQ13951 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CBFBQ13951 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBFBQ13951 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CBFBQ13951 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBFBQ13951 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBFBQ13951 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CBFBQ13951 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBFBQ13951 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CBFBQ13951 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBFBQ13951 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBFBQ13951 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBFBQ13951 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CBFBQ13951 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBFBQ13951 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CBFBQ13951 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBFBQ13951 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CBFBQ13951 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBFBQ13951 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBFBQ13951 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBFBQ13951 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CBFBQ13951 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CBFBQ13951 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBFBQ13951 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBFBQ13951 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CBFBQ13951 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CBFBQ13951 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBFBQ13951 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CBFBQ13951 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CBFBQ13951 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBFBQ13951 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
CBFBQ13951 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CBFBQ13951 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBFBQ13951 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CBFBQ13951 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBFBQ13951 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
CBFBQ13951 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBFBQ13951 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBFBQ13951 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBFBQ13951 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CBFBQ13951 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBFBQ13951 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBFBQ13951 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBFBQ13951 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CBFBQ13951 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBFBQ13951 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CBFBQ13951 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBFBQ13951 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CBFBQ13951 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CBFBQ13951 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBFBQ13951 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBFBQ13951 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBFBQ13951 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CBFBQ13951 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBFBQ13951 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBFBQ13951 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBFBQ13951 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CBFBQ13951 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBFBQ13951 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBFBQ13951 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBFBQ13951 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CBFBQ13951 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBFBQ13951 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBFBQ13951 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBFBQ13951 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBFBQ13951 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CBFBQ13951 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBFBQ13951 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBFBQ13951 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CBFBQ13951 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBFBQ13951 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBFBQ13951 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CBFBQ13951 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CBFBQ13951 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBFBQ13951 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBFBQ13951 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBFBQ13951 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CBFBQ13951 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms