Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
FOXE3Q13461 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXE3Q13461 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
FOXE3Q13461 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
FOXE3Q13461 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXE3Q13461 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXE3Q13461 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXE3Q13461 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
FOXE3Q13461 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXE3Q13461 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXE3Q13461 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXE3Q13461 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
FOXE3Q13461 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXE3Q13461 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
FOXE3Q13461 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXE3Q13461 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXE3Q13461 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
FOXE3Q13461 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXE3Q13461 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXE3Q13461 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXE3Q13461 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
FOXE3Q13461 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
FOXE3Q13461 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
FOXE3Q13461 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXE3Q13461 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
FOXE3Q13461 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXE3Q13461 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXE3Q13461 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXE3Q13461 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXE3Q13461 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXE3Q13461 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FOXE3Q13461 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXE3Q13461 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXE3Q13461 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXE3Q13461 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FOXE3Q13461 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXE3Q13461 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXE3Q13461 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FOXE3Q13461 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXE3Q13461 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FOXE3Q13461 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXE3Q13461 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXE3Q13461 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FOXE3Q13461 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXE3Q13461 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXE3Q13461 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXE3Q13461 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXE3Q13461 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
FOXE3Q13461 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXE3Q13461 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXE3Q13461 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
FOXE3Q13461 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXE3Q13461 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXE3Q13461 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXE3Q13461 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXE3Q13461 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXE3Q13461 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
FOXE3Q13461 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXE3Q13461 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXE3Q13461 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXE3Q13461 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXE3Q13461 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXE3Q13461 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXE3Q13461 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
FOXE3Q13461 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
FOXE3Q13461 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXE3Q13461 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXE3Q13461 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXE3Q13461 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXE3Q13461 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXE3Q13461 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXE3Q13461 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
FOXE3Q13461 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXE3Q13461 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
FOXE3Q13461 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
FOXE3Q13461 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXE3Q13461 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXE3Q13461 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXE3Q13461 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXE3Q13461 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXE3Q13461 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXE3Q13461 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXE3Q13461 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXE3Q13461 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
FOXE3Q13461 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXE3Q13461 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
FOXE3Q13461 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXE3Q13461 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
FOXE3Q13461 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXE3Q13461 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXE3Q13461 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXE3Q13461 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
FOXE3Q13461 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXE3Q13461 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXE3Q13461 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
FOXE3Q13461 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
FOXE3Q13461 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
FOXE3Q13461 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
FOXE3Q13461 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
FOXE3Q13461 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
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