Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

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Length 319 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC26.78■■□□□ 1.88
FOXE3Q13461 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXE3Q13461 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXE3Q13461 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
FOXE3Q13461 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
FOXE3Q13461 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXE3Q13461 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
FOXE3Q13461 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
FOXE3Q13461 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
FOXE3Q13461 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FOXE3Q13461 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
FOXE3Q13461 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
FOXE3Q13461 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FOXE3Q13461 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FOXE3Q13461 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
FOXE3Q13461 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXE3Q13461 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXE3Q13461 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXE3Q13461 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXE3Q13461 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXE3Q13461 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXE3Q13461 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FOXE3Q13461 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FOXE3Q13461 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
FOXE3Q13461 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
FOXE3Q13461 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXE3Q13461 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
FOXE3Q13461 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
FOXE3Q13461 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXE3Q13461 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
FOXE3Q13461 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXE3Q13461 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
FOXE3Q13461 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
FOXE3Q13461 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
FOXE3Q13461 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
FOXE3Q13461 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
FOXE3Q13461 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
FOXE3Q13461 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXE3Q13461 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FOXE3Q13461 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
FOXE3Q13461 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FOXE3Q13461 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FOXE3Q13461 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FOXE3Q13461 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FOXE3Q13461 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FOXE3Q13461 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FOXE3Q13461 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
FOXE3Q13461 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
FOXE3Q13461 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
FOXE3Q13461 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
FOXE3Q13461 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
FOXE3Q13461 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
FOXE3Q13461 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FOXE3Q13461 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FOXE3Q13461 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FOXE3Q13461 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FOXE3Q13461 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FOXE3Q13461 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FOXE3Q13461 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
FOXE3Q13461 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
FOXE3Q13461 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
FOXE3Q13461 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
FOXE3Q13461 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXE3Q13461 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
FOXE3Q13461 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXE3Q13461 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
FOXE3Q13461 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
FOXE3Q13461 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
FOXE3Q13461 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
FOXE3Q13461 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
FOXE3Q13461 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
FOXE3Q13461 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
FOXE3Q13461 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
FOXE3Q13461 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXE3Q13461 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
FOXE3Q13461 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
FOXE3Q13461 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
FOXE3Q13461 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXE3Q13461 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
FOXE3Q13461 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
FOXE3Q13461 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
FOXE3Q13461 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXE3Q13461 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
FOXE3Q13461 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
FOXE3Q13461 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
FOXE3Q13461 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
FOXE3Q13461 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
FOXE3Q13461 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXE3Q13461 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXE3Q13461 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
FOXE3Q13461 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
FOXE3Q13461 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
FOXE3Q13461 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
FOXE3Q13461 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
FOXE3Q13461 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
FOXE3Q13461 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXE3Q13461 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FOXE3Q13461 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXE3Q13461 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
FOXE3Q13461 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
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