Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ITGB3BPQ13352 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ITGB3BPQ13352 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ITGB3BPQ13352 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ITGB3BPQ13352 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
ITGB3BPQ13352 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ITGB3BPQ13352 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
ITGB3BPQ13352 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ITGB3BPQ13352 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
ITGB3BPQ13352 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
ITGB3BPQ13352 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
ITGB3BPQ13352 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
ITGB3BPQ13352 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.15■■■□□ 2.42
ITGB3BPQ13352 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ITGB3BPQ13352 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ITGB3BPQ13352 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ITGB3BPQ13352 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
ITGB3BPQ13352 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
ITGB3BPQ13352 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
ITGB3BPQ13352 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGB3BPQ13352 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
ITGB3BPQ13352 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ITGB3BPQ13352 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
ITGB3BPQ13352 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGB3BPQ13352 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGB3BPQ13352 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGB3BPQ13352 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
ITGB3BPQ13352 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ITGB3BPQ13352 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
ITGB3BPQ13352 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
ITGB3BPQ13352 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGB3BPQ13352 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGB3BPQ13352 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGB3BPQ13352 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGB3BPQ13352 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
ITGB3BPQ13352 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ITGB3BPQ13352 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
ITGB3BPQ13352 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ITGB3BPQ13352 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ITGB3BPQ13352 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
ITGB3BPQ13352 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
ITGB3BPQ13352 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
ITGB3BPQ13352 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITGB3BPQ13352 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
ITGB3BPQ13352 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGB3BPQ13352 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGB3BPQ13352 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGB3BPQ13352 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGB3BPQ13352 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
ITGB3BPQ13352 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
ITGB3BPQ13352 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ITGB3BPQ13352 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
ITGB3BPQ13352 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
ITGB3BPQ13352 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
ITGB3BPQ13352 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ITGB3BPQ13352 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ITGB3BPQ13352 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
ITGB3BPQ13352 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGB3BPQ13352 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.99■■■□□ 2.39
ITGB3BPQ13352 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
ITGB3BPQ13352 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGB3BPQ13352 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGB3BPQ13352 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGB3BPQ13352 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
ITGB3BPQ13352 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGB3BPQ13352 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGB3BPQ13352 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
ITGB3BPQ13352 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.39
ITGB3BPQ13352 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
ITGB3BPQ13352 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ITGB3BPQ13352 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
ITGB3BPQ13352 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITGB3BPQ13352 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITGB3BPQ13352 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITGB3BPQ13352 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
ITGB3BPQ13352 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGB3BPQ13352 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGB3BPQ13352 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
ITGB3BPQ13352 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITGB3BPQ13352 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITGB3BPQ13352 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITGB3BPQ13352 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
ITGB3BPQ13352 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ITGB3BPQ13352 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.89■■■□□ 2.38
ITGB3BPQ13352 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ITGB3BPQ13352 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
ITGB3BPQ13352 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITGB3BPQ13352 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITGB3BPQ13352 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITGB3BPQ13352 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITGB3BPQ13352 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
ITGB3BPQ13352 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
ITGB3BPQ13352 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
ITGB3BPQ13352 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
ITGB3BPQ13352 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITGB3BPQ13352 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITGB3BPQ13352 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITGB3BPQ13352 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
ITGB3BPQ13352 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
ITGB3BPQ13352 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
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