Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
NFX1Q12986 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
NFX1Q12986 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
NFX1Q12986 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NFX1Q12986 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
NFX1Q12986 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
NFX1Q12986 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
NFX1Q12986 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NFX1Q12986 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
NFX1Q12986 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NFX1Q12986 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
NFX1Q12986 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
NFX1Q12986 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
NFX1Q12986 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
NFX1Q12986 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
NFX1Q12986 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
NFX1Q12986 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NFX1Q12986 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
NFX1Q12986 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
NFX1Q12986 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NFX1Q12986 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
NFX1Q12986 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NFX1Q12986 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NFX1Q12986 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
NFX1Q12986 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
NFX1Q12986 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NFX1Q12986 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
NFX1Q12986 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NFX1Q12986 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NFX1Q12986 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
NFX1Q12986 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
NFX1Q12986 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NFX1Q12986 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
NFX1Q12986 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NFX1Q12986 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
NFX1Q12986 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
NFX1Q12986 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NFX1Q12986 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
NFX1Q12986 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
NFX1Q12986 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
NFX1Q12986 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
NFX1Q12986 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
NFX1Q12986 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NFX1Q12986 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NFX1Q12986 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
NFX1Q12986 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NFX1Q12986 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
NFX1Q12986 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFX1Q12986 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
NFX1Q12986 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NFX1Q12986 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NFX1Q12986 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.28■■■□□ 2.28
NFX1Q12986 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
NFX1Q12986 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NFX1Q12986 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
NFX1Q12986 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
NFX1Q12986 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
NFX1Q12986 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NFX1Q12986 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NFX1Q12986 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NFX1Q12986 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NFX1Q12986 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NFX1Q12986 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NFX1Q12986 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NFX1Q12986 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NFX1Q12986 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
NFX1Q12986 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NFX1Q12986 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NFX1Q12986 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NFX1Q12986 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NFX1Q12986 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFX1Q12986 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NFX1Q12986 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NFX1Q12986 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NFX1Q12986 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NFX1Q12986 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NFX1Q12986 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NFX1Q12986 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NFX1Q12986 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NFX1Q12986 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NFX1Q12986 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NFX1Q12986 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NFX1Q12986 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NFX1Q12986 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NFX1Q12986 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NFX1Q12986 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NFX1Q12986 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFX1Q12986 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFX1Q12986 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFX1Q12986 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NFX1Q12986 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NFX1Q12986 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NFX1Q12986 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NFX1Q12986 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFX1Q12986 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFX1Q12986 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFX1Q12986 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFX1Q12986 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NFX1Q12986 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NFX1Q12986 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
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