Protein–RNA interactions for Protein: Q12048

ATG41, Autophagy-related protein 41, yeastyeast

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG41Q12048 AIM45YPR004C 1035 nt8.27□□□□□ -1.09
ATG41Q12048 VPS62YGR141W 1404 nt8.27□□□□□ -1.09
ATG41Q12048 MSF1YPR047W 1410 nt8.25□□□□□ -1.09
ATG41Q12048 DLD2YDL178W 1593 nt8.25□□□□□ -1.09
ATG41Q12048 YGL034CYGL034C 366 nt8.24□□□□□ -1.09
ATG41Q12048 YDL086WYDL086W 822 nt8.23□□□□□ -1.09
ATG41Q12048 PSD1YNL169C 1503 nt8.23□□□□□ -1.09
ATG41Q12048 UGA4YDL210W 1716 nt8.23□□□□□ -1.09
ATG41Q12048 GID8YMR135C 1368 nt8.22□□□□□ -1.09
ATG41Q12048 NAT4YMR069W 858 nt8.22□□□□□ -1.09
ATG41Q12048 DIG1YPL049C 1359 nt8.21□□□□□ -1.1
ATG41Q12048 SSN3YPL042C 1668 nt8.21□□□□□ -1.1
ATG41Q12048 MRS6YOR370C 1812 nt8.2□□□□□ -1.1
ATG41Q12048 HEM13YDR044W 987 nt8.2□□□□□ -1.1
ATG41Q12048 ODC1YPL134C 933 nt8.2□□□□□ -1.1
ATG41Q12048 SEC61YLR378C 1443 nt8.2□□□□□ -1.1
ATG41Q12048 DMA2YNL116W 1569 nt8.19□□□□□ -1.1
ATG41Q12048 OXA1YER154W 1209 nt8.18□□□□□ -1.1
ATG41Q12048 SSL2YIL143C 2532 nt8.16□□□□□ -1.1
ATG41Q12048 YKL133CYKL133C 1392 nt8.16□□□□□ -1.1
ATG41Q12048 BNI5YNL166C 1347 nt8.16□□□□□ -1.1
ATG41Q12048 YLR279WYLR279W 390 nt8.15□□□□□ -1.1
ATG41Q12048 CYT1YOR065W 930 nt8.14□□□□□ -1.11
ATG41Q12048 MSB4YOL112W 1479 nt8.13□□□□□ -1.11
ATG41Q12048 YHL008CYHL008C 1884 nt8.13□□□□□ -1.11
ATG41Q12048 YHR219WYHR219W 1875 nt8.13□□□□□ -1.11
ATG41Q12048 YER188WYER188W 720 nt8.13□□□□□ -1.11
ATG41Q12048 RBG1YAL036C 1110 nt8.13□□□□□ -1.11
ATG41Q12048 TSC10YBR265W 963 nt8.13□□□□□ -1.11
ATG41Q12048 MET2YNL277W 1461 nt8.13□□□□□ -1.11
ATG41Q12048 FUB1YCR076C 753 nt8.12□□□□□ -1.11
ATG41Q12048 MSC1YML128C 1542 nt8.11□□□□□ -1.11
ATG41Q12048 YHR218WYHR218W 1812 nt8.1□□□□□ -1.11
ATG41Q12048 PHO23YNL097C 993 nt8.1□□□□□ -1.11
ATG41Q12048 TAT2YOL020W 1779 nt8.1□□□□□ -1.11
ATG41Q12048 AIM1YAL046C 357 nt8.09□□□□□ -1.11
ATG41Q12048 OSH7YHR001W 1314 nt8.08□□□□□ -1.12
ATG41Q12048 SFP1YLR403W 2052 nt8.08□□□□□ -1.12
ATG41Q12048 YGR012WYGR012W 1182 nt8.08□□□□□ -1.12
ATG41Q12048 FCY21YER060W 1587 nt8.07□□□□□ -1.12
ATG41Q12048 UBX6YJL048C 1191 nt8.07□□□□□ -1.12
ATG41Q12048 LSR1LSR1 1175 nt8.06□□□□□ -1.12
ATG41Q12048 MDM35YKL053C-A 261 nt8.05□□□□□ -1.12
ATG41Q12048 SDH5YOL071W 489 nt8.05□□□□□ -1.12
ATG41Q12048 DLD3YEL071W 1491 nt8.05□□□□□ -1.12
ATG41Q12048 HXT10YFL011W 1641 nt8.04□□□□□ -1.12
ATG41Q12048 APT2YDR441C 546 nt8.04□□□□□ -1.12
ATG41Q12048 CSM1YCR086W 573 nt8.03□□□□□ -1.12
ATG41Q12048 YLR046CYLR046C 813 nt8.03□□□□□ -1.12
ATG41Q12048 SOL2YCR073W-A 948 nt8.02□□□□□ -1.13
ATG41Q12048 RAS2YNL098C 969 nt8.02□□□□□ -1.13
ATG41Q12048 TPO4YOR273C 1980 nt8.01□□□□□ -1.13
ATG41Q12048 CWP2YKL096W-A 279 nt8.01□□□□□ -1.13
ATG41Q12048 NUC1YJL208C 990 nt8□□□□□ -1.13
ATG41Q12048 HMG2YLR450W 3138 nt7.99□□□□□ -1.13
ATG41Q12048 ITR2YOL103W 1830 nt7.99□□□□□ -1.13
ATG41Q12048 TIM44YIL022W 1296 nt7.99□□□□□ -1.13
ATG41Q12048 PRY1YJL079C 900 nt7.99□□□□□ -1.13
ATG41Q12048 RPD3YNL330C 1302 nt7.99□□□□□ -1.13
ATG41Q12048 YDR455CYDR455C 309 nt7.98□□□□□ -1.13
ATG41Q12048 ASP3-1YLR155C 1089 nt7.98□□□□□ -1.13
ATG41Q12048 ASP3-2YLR157C 1089 nt7.98□□□□□ -1.13
ATG41Q12048 ASP3-3YLR158C 1089 nt7.98□□□□□ -1.13
ATG41Q12048 ASP3-4YLR160C 1089 nt7.98□□□□□ -1.13
ATG41Q12048 GPN2YOR262W 1044 nt7.98□□□□□ -1.13
ATG41Q12048 SAM3YPL274W 1764 nt7.97□□□□□ -1.13
ATG41Q12048 ENT4YLL038C 744 nt7.97□□□□□ -1.13
ATG41Q12048 YPL222C-AYPL222C-A 246 nt7.95□□□□□ -1.14
ATG41Q12048 SMM1YNR015W 1155 nt7.94□□□□□ -1.14
ATG41Q12048 EAF3YPR023C 1206 nt7.94□□□□□ -1.14
ATG41Q12048 LSB5YCL034W 1065 nt7.93□□□□□ -1.14
ATG41Q12048 AGP3YFL055W 1677 nt7.92□□□□□ -1.14
ATG41Q12048 CAB5YDR196C 726 nt7.92□□□□□ -1.14
ATG41Q12048 YMR262WYMR262W 942 nt7.92□□□□□ -1.14
ATG41Q12048 VMA11YPL234C 495 nt7.92□□□□□ -1.14
ATG41Q12048 LSM5YER146W 282 nt7.91□□□□□ -1.14
ATG41Q12048 OYE2YHR179W 1203 nt7.91□□□□□ -1.14
ATG41Q12048 TIP1YBR067C 633 nt7.91□□□□□ -1.14
ATG41Q12048 ALD5YER073W 1563 nt7.89□□□□□ -1.15
ATG41Q12048 GND1YHR183W 1470 nt7.89□□□□□ -1.15
ATG41Q12048 ERG13YML126C 1476 nt7.89□□□□□ -1.15
ATG41Q12048 RPT5YOR117W 1305 nt7.89□□□□□ -1.15
ATG41Q12048 RAD23YEL037C 1197 nt7.89□□□□□ -1.15
ATG41Q12048 RPC31YNL151C 756 nt7.89□□□□□ -1.15
ATG41Q12048 HXK1YFR053C 1458 nt7.88□□□□□ -1.15
ATG41Q12048 TPS1YBR126C 1488 nt7.88□□□□□ -1.15
ATG41Q12048 SAC7YDR389W 1965 nt7.88□□□□□ -1.15
ATG41Q12048 DDI1YER143W 1287 nt7.88□□□□□ -1.15
ATG41Q12048 YJL118WYJL118W 660 nt7.88□□□□□ -1.15
ATG41Q12048 RIM2YBR192W 1134 nt7.88□□□□□ -1.15
ATG41Q12048 DPL1YDR294C 1770 nt7.88□□□□□ -1.15
ATG41Q12048 RPM1RPM1 483 nt7.87□□□□□ -1.15
ATG41Q12048 SNX3YOR357C 489 nt7.86□□□□□ -1.15
ATG41Q12048 NBA1YOL070C 1506 nt7.85□□□□□ -1.15
ATG41Q12048 YJL055WYJL055W 738 nt7.85□□□□□ -1.15
ATG41Q12048 LEU4YNL104C 1860 nt7.83□□□□□ -1.16
ATG41Q12048 RIB3YDR487C 627 nt7.83□□□□□ -1.16
ATG41Q12048 YFL015W-AYFL015W-A 318 nt7.83□□□□□ -1.16
ATG41Q12048 PCP1YGR101W 1041 nt7.83□□□□□ -1.16
ATG41Q12048 LOT5YKL183W 921 nt7.83□□□□□ -1.16
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 20.4 ms