RNA–Protein interactions for RNA: YHL008C

YHL008C, Transcript of Putative protein of unknown function, yeastyeast

Gene YHL008C, Length 1,884 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YHL008CYHL008C BFR2Q06631 534 aaKnown RBP13.05□□□□□ -0.32
YHL008CYHL008C SGS1P35187 1447 aa13.01□□□□□ -0.33
YHL008CYHL008C NOP2P40991 618 aaKnown RBP12.76□□□□□ -0.37
YHL008CYHL008C INO80P53115 1489 aa12.7□□□□□ -0.38
YHL008CYHL008C SPA2P23201 1466 aaKnown RBP12.69□□□□□ -0.38
YHL008CYHL008C RQC2Q12532 1038 aaKnown RBP12.5□□□□□ -0.41
YHL008CYHL008C TCB3Q03640 1545 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
YHL008CYHL008C SSN2P38931 1420 aa12.47□□□□□ -0.41
YHL008CYHL008C NSR1P27476 414 aaKnown RBP RIP-Chip data12.41□□□□□ -0.42not detected
YHL008CYHL008C SKI3P17883 1432 aaKnown RBP12.41□□□□□ -0.42
YHL008CYHL008C TY1B-DR4Q07793 1604 aa12.27□□□□□ -0.45
YHL008CYHL008C DRS1P32892 752 aaKnown RBP12.24□□□□□ -0.45
YHL008CYHL008C CAB3P36076 571 aa12.14□□□□□ -0.47
YHL008CYHL008C MON2P48563 1636 aaPredicted RBP12.13□□□□□ -0.47
YHL008CYHL008C HSL1P34244 1518 aa12.1□□□□□ -0.47
YHL008CYHL008C SPT6P23615 1451 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
YHL008CYHL008C EBP2P36049 427 aaKnown RBP12.08□□□□□ -0.48
YHL008CYHL008C SWR1Q05471 1514 aa11.98□□□□□ -0.49
YHL008CYHL008C HIR3P47171 1648 aa11.89□□□□□ -0.51
YHL008CYHL008C XRN1P22147 1528 aaKnown RBP11.85□□□□□ -0.51
YHL008CYHL008C ENP1P38333 483 aaKnown RBP11.78□□□□□ -0.52
YHL008CYHL008C YPR148CQ06523 435 aa11.74□□□□□ -0.53
YHL008CYHL008C MMS22Q06164 1454 aa11.7□□□□□ -0.54
YHL008CYHL008C REV3P14284 1504 aa11.68□□□□□ -0.54
YHL008CYHL008C CHD1P32657 1468 aa11.67□□□□□ -0.54
YHL008CYHL008C SIN3P22579 1536 aa11.59□□□□□ -0.55
YHL008CYHL008C SIS2P36024 562 aa11.59□□□□□ -0.55
YHL008CYHL008C DNA2P38859 1522 aa11.59□□□□□ -0.55
YHL008CYHL008C THO2P53552 1597 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
YHL008CYHL008C TAF2P23255 1407 aa11.57□□□□□ -0.56
YHL008CYHL008C RSE1Q04693 1361 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
YHL008CYHL008C UFD4P33202 1483 aa11.54□□□□□ -0.56
YHL008CYHL008C KOG1P38873 1557 aa11.54□□□□□ -0.56
YHL008CYHL008C SSK2P53599 1579 aa11.53□□□□□ -0.56
YHL008CYHL008C POL5P39985 1022 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
YHL008CYHL008C BUD4P47136 1447 aa11.46□□□□□ -0.57
YHL008CYHL008C STH1P32597 1359 aa11.46□□□□□ -0.58
YHL008CYHL008C URN1Q06525 465 aaKnown RBP11.45□□□□□ -0.58
YHL008CYHL008C SPP41P38904 1435 aa11.44□□□□□ -0.58
YHL008CYHL008C TAF7Q05021 590 aa11.42□□□□□ -0.58
YHL008CYHL008C ECM5Q03214 1411 aa11.42□□□□□ -0.58
YHL008CYHL008C SPT7P35177 1332 aa11.41□□□□□ -0.58
YHL008CYHL008C ESP1Q03018 1630 aa11.4□□□□□ -0.58
YHL008CYHL008C IKI3Q06706 1349 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
YHL008CYHL008C TFA1P36100 482 aa11.39□□□□□ -0.59
YHL008CYHL008C MYO2P19524 1574 aaKnown RBP11.39□□□□□ -0.59
YHL008CYHL008C SEC3P33332 1336 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
YHL008CYHL008C TRM732Q03496 1420 aa11.37□□□□□ -0.59
YHL008CYHL008C PRS1P32895 427 aaKnown RBP11.34□□□□□ -0.59
YHL008CYHL008C MNN4P36044 1178 aa11.34□□□□□ -0.59
YHL008CYHL008C ATG2P53855 1592 aa11.33□□□□□ -0.6
YHL008CYHL008C TCB2P48231 1178 aa11.33□□□□□ -0.6
YHL008CYHL008C SAS10Q12136 610 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
YHL008CYHL008C CLC1P17891 233 aa11.29□□□□□ -0.6
YHL008CYHL008C YPK9Q12697 1472 aa11.28□□□□□ -0.6
YHL008CYHL008C POL1P13382 1468 aa11.27□□□□□ -0.6
YHL008CYHL008C STU1P38198 1513 aa11.23□□□□□ -0.61
YHL008CYHL008C MDS3P53094 1487 aa11.23□□□□□ -0.61
YHL008CYHL008C PEP1P32319 1579 aa11.22□□□□□ -0.61
YHL008CYHL008C IME2P32581 645 aa11.22□□□□□ -0.61
YHL008CYHL008C YTA7P40340 1379 aa11.19□□□□□ -0.62
YHL008CYHL008C SSM4P40318 1319 aa11.17□□□□□ -0.62
YHL008CYHL008C SCC2Q04002 1493 aa11.16□□□□□ -0.62
YHL008CYHL008C AVT3P36062 692 aa11.15□□□□□ -0.62
YHL008CYHL008C RTT106P40161 455 aa11.15□□□□□ -0.62
YHL008CYHL008C YFR016CP43597 1233 aaKnown RBP11.15□□□□□ -0.63
YHL008CYHL008C LEO1P38439 464 aa11.14□□□□□ -0.63
YHL008CYHL008C EAF7P53911 425 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
YHL008CYHL008C RPO31P04051 1460 aa11.11□□□□□ -0.63
YHL008CYHL008C RKR1Q04781 1562 aa11.1□□□□□ -0.63
YHL008CYHL008C YOR1P53049 1477 aa11.1□□□□□ -0.63
YHL008CYHL008C BPT1P14772 1559 aa11.09□□□□□ -0.63
YHL008CYHL008C LEU3P08638 886 aa11.08□□□□□ -0.64
YHL008CYHL008C TOP2P06786 1428 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
YHL008CYHL008C OPY1P38271 328 aa11.06□□□□□ -0.64
YHL008CYHL008C CFT1Q06632 1357 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
YHL008CYHL008C AIM44Q99299 758 aa11.05□□□□□ -0.64
YHL008CYHL008C RPC31P17890 251 aa11.04□□□□□ -0.64
YHL008CYHL008C MYO4P32492 1471 aa11.03□□□□□ -0.64
YHL008CYHL008C SMC4Q12267 1418 aa11.02□□□□□ -0.64
YHL008CYHL008C QCR6P00127 147 aa11.02□□□□□ -0.64
YHL008CYHL008C NUP170P38181 1502 aa11.01□□□□□ -0.65
YHL008CYHL008C YCF1P39109 1515 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
YHL008CYHL008C SRB8P25648 1427 aa10.98□□□□□ -0.65
YHL008CYHL008C PDR10P51533 1564 aa10.98□□□□□ -0.65
YHL008CYHL008C SNF7P39929 240 aaKnown RBP10.94□□□□□ -0.66
YHL008CYHL008C RPS0BP46654 252 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
YHL008CYHL008C PSD2P53037 1138 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
YHL008CYHL008C PAN1P32521 1480 aa10.93□□□□□ -0.66
YHL008CYHL008C FPR3P38911 411 aaKnown RBP10.93□□□□□ -0.66
YHL008CYHL008C YLR419WQ06698 1435 aaKnown RBP10.9□□□□□ -0.66
YHL008CYHL008C TY2B-LR1P0C2J3 1770 aa10.89□□□□□ -0.67
YHL008CYHL008C TY2B-FP0CX63 1770 aa10.89□□□□□ -0.67
YHL008CYHL008C TY2B-GR2P0CX64 1770 aa10.89□□□□□ -0.67
YHL008CYHL008C TY2B-CP25384 1770 aa10.89□□□□□ -0.67
YHL008CYHL008C TY2B-DR2Q03494 1770 aa10.89□□□□□ -0.67
YHL008CYHL008C TY1B-DR1Q03855 1755 aa10.89□□□□□ -0.67
YHL008CYHL008C TY2B-DR3Q07791 1770 aaKnown RBP10.89□□□□□ -0.67
YHL008CYHL008C TY2B-OR1Q12113 1770 aa10.89□□□□□ -0.67
YHL008CYHL008C TY2B-DR1Q12472 1770 aa10.89□□□□□ -0.67
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