Protein–RNA interactions for Protein: Q12048

ATG41, Autophagy-related protein 41, yeastyeast

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
ATG41Q12048 NSR1YGR159C 1245 nt17.8■□□□□ 0.44
ATG41Q12048 YML009W-BYML009W-B 477 nt17.55■□□□□ 0.4
ATG41Q12048 NOP1YDL014W 984 nt16.81■□□□□ 0.28
ATG41Q12048 MDJ1YFL016C 1536 nt16.32■□□□□ 0.2
ATG41Q12048 YKL036CYKL036C 393 nt15.1■□□□□ 0.01
ATG41Q12048 YJL027CYJL027C 417 nt14.97□□□□□ -0.01
ATG41Q12048 SRX1YKL086W 384 nt14.71□□□□□ -0.05
ATG41Q12048 Q0297Q0297 156 nt14.59□□□□□ -0.07
ATG41Q12048 DBP2YNL112W 1641 nt14.26□□□□□ -0.13
ATG41Q12048 YBR190WYBR190W 312 nt13.99□□□□□ -0.17
ATG41Q12048 YCR051WYCR051W 669 nt13.94□□□□□ -0.18
ATG41Q12048 RTC3YHR087W 336 nt13.66□□□□□ -0.22
ATG41Q12048 TRN1tP(UGG)A 72 nt13.61□□□□□ -0.23
ATG41Q12048 SUF9tP(UGG)F 72 nt13.61□□□□□ -0.23
ATG41Q12048 SUF8tP(UGG)H 72 nt13.61□□□□□ -0.23
ATG41Q12048 tP(UGG)LtP(UGG)L 72 nt13.61□□□□□ -0.23
ATG41Q12048 SUF7tP(UGG)M 72 nt13.61□□□□□ -0.23
ATG41Q12048 tP(UGG)N1tP(UGG)N1 72 nt13.61□□□□□ -0.23
ATG41Q12048 tP(UGG)N2tP(UGG)N2 72 nt13.61□□□□□ -0.23
ATG41Q12048 tP(UGG)O1tP(UGG)O1 72 nt13.61□□□□□ -0.23
ATG41Q12048 SUF11tP(UGG)O2 72 nt13.61□□□□□ -0.23
ATG41Q12048 SCS3YGL126W 1143 nt13.54□□□□□ -0.24
ATG41Q12048 CCC1YLR220W 969 nt13.47□□□□□ -0.25
ATG41Q12048 SSA3YBL075C 1950 nt13.4□□□□□ -0.26
ATG41Q12048 RVS167YDR388W 1449 nt13.22□□□□□ -0.29
ATG41Q12048 SCJ1YMR214W 1134 nt13.15□□□□□ -0.3
ATG41Q12048 PUT4YOR348C 1884 nt13.11□□□□□ -0.31
ATG41Q12048 YOL085CYOL085C 342 nt13.11□□□□□ -0.31
ATG41Q12048 RPP1BYDL130W 321 nt13.09□□□□□ -0.31
ATG41Q12048 PKP1YIL042C 1185 nt13□□□□□ -0.33
ATG41Q12048 ARE1YCR048W 1833 nt12.74□□□□□ -0.37
ATG41Q12048 tP(UGG)O3tP(UGG)O3 72 nt12.7□□□□□ -0.38
ATG41Q12048 SHR5YOL110W 714 nt12.67□□□□□ -0.38
ATG41Q12048 POA1YBR022W 534 nt12.64□□□□□ -0.39
ATG41Q12048 URN1YPR152C 1398 nt12.63□□□□□ -0.39
ATG41Q12048 SAH1YER043C 1350 nt12.6□□□□□ -0.39
ATG41Q12048 PET122YER153C 765 nt12.6□□□□□ -0.39
ATG41Q12048 YHR049C-AYHR049C-A 297 nt12.56□□□□□ -0.4
ATG41Q12048 OPI9YLR338W 858 nt12.54□□□□□ -0.4
ATG41Q12048 DEP1YAL013W 1218 nt12.51□□□□□ -0.41
ATG41Q12048 BSC6YOL137W 1494 nt12.46□□□□□ -0.41
ATG41Q12048 RPN10YHR200W 807 nt12.29□□□□□ -0.44
ATG41Q12048 SPT5YML010W 3192 nt12.28□□□□□ -0.44
ATG41Q12048 SCR1SCR1 522 nt12.28□□□□□ -0.44
ATG41Q12048 YDJ1YNL064C 1230 nt12.27□□□□□ -0.45
ATG41Q12048 BUD23YCR047C 828 nt12.23□□□□□ -0.45
ATG41Q12048 YNL208WYNL208W 600 nt12.21□□□□□ -0.45
ATG41Q12048 RRN5YLR141W 1092 nt12.16□□□□□ -0.46
ATG41Q12048 PUN1YLR414C 792 nt12.15□□□□□ -0.46
ATG41Q12048 PTC2YER089C 1395 nt12.11□□□□□ -0.47
ATG41Q12048 GAR1YHR089C 618 nt12.11□□□□□ -0.47
ATG41Q12048 SSA4YER103W 1929 nt12.04□□□□□ -0.48
ATG41Q12048 YJR018WYJR018W 363 nt12.01□□□□□ -0.49
ATG41Q12048 NAB2YGL122C 1578 nt12□□□□□ -0.49
ATG41Q12048 ATS1YAL020C 1002 nt11.95□□□□□ -0.5
ATG41Q12048 YER088W-BYER088W-B 147 nt11.93□□□□□ -0.5
ATG41Q12048 FIS1YIL065C 468 nt11.83□□□□□ -0.52
ATG41Q12048 YJR120WYJR120W 351 nt11.78□□□□□ -0.52
ATG41Q12048 RSB1YOR049C 1065 nt11.77□□□□□ -0.53
ATG41Q12048 DAL1YIR027C 1383 nt11.76□□□□□ -0.53
ATG41Q12048 MEP2YNL142W 1500 nt11.75□□□□□ -0.53
ATG41Q12048 TIR1YER011W 765 nt11.72□□□□□ -0.53
ATG41Q12048 FPR4YLR449W 1179 nt11.72□□□□□ -0.53
ATG41Q12048 SSA1YAL005C 1929 nt11.7□□□□□ -0.54
ATG41Q12048 PHO4YFR034C 939 nt11.66□□□□□ -0.54
ATG41Q12048 BDF1YLR399C 2061 nt11.64□□□□□ -0.55
ATG41Q12048 YPS1YLR120C 1710 nt11.61□□□□□ -0.55
ATG41Q12048 RPP2BYDR382W 333 nt11.61□□□□□ -0.55
ATG41Q12048 INM2YDR287W 879 nt11.6□□□□□ -0.55
ATG41Q12048 DCW1YKL046C 1350 nt11.58□□□□□ -0.56
ATG41Q12048 YHR165W-AYHR165W-A 312 nt11.49□□□□□ -0.57
ATG41Q12048 TAT1YBR069C 1860 nt11.47□□□□□ -0.57
ATG41Q12048 SRB2YHR041C 633 nt11.46□□□□□ -0.57
ATG41Q12048 YDR095CYDR095C 411 nt11.45□□□□□ -0.58
ATG41Q12048 YBL100CYBL100C 315 nt11.45□□□□□ -0.58
ATG41Q12048 EMI2YDR516C 1503 nt11.39□□□□□ -0.59
ATG41Q12048 YBR220CYBR220C 1683 nt11.34□□□□□ -0.59
ATG41Q12048 BDH2YAL061W 1254 nt11.32□□□□□ -0.6
ATG41Q12048 FUN26YAL022C 1554 nt11.31□□□□□ -0.6
ATG41Q12048 YMR090WYMR090W 684 nt11.3□□□□□ -0.6
ATG41Q12048 CAC2YML102W 1407 nt11.27□□□□□ -0.6
ATG41Q12048 YDL221WYDL221W 552 nt11.27□□□□□ -0.61
ATG41Q12048 PTP1YDL230W 1008 nt11.26□□□□□ -0.61
ATG41Q12048 SDH1YKL148C 1923 nt11.23□□□□□ -0.61
ATG41Q12048 ALF1YNL148C 765 nt11.22□□□□□ -0.61
ATG41Q12048 RPP2AYOL039W 321 nt11.22□□□□□ -0.61
ATG41Q12048 TRM9YML014W 840 nt11.17□□□□□ -0.62
ATG41Q12048 PST2YDR032C 597 nt11.16□□□□□ -0.62
ATG41Q12048 WWM1YFL010C 636 nt11.14□□□□□ -0.63
ATG41Q12048 CCT6YDR188W 1641 nt11.11□□□□□ -0.63
ATG41Q12048 IRC15YPL017C 1500 nt11.09□□□□□ -0.63
ATG41Q12048 SCC4YER147C 1875 nt11.08□□□□□ -0.64
ATG41Q12048 SIS1YNL007C 1059 nt11.08□□□□□ -0.64
ATG41Q12048 LSM3YLR438C-A 270 nt11.06□□□□□ -0.64
ATG41Q12048 GIS3YLR094C 1509 nt11.03□□□□□ -0.64
ATG41Q12048 SUF2tP(AGG)C 72 nt11.02□□□□□ -0.65
ATG41Q12048 SUF10tP(AGG)N 72 nt11.02□□□□□ -0.65
ATG41Q12048 PCH2YBR186W 1695 nt11.01□□□□□ -0.65
ATG41Q12048 GFD2YCL036W 1701 nt10.98□□□□□ -0.65
ATG41Q12048 ART5YGR068C 1761 nt10.98□□□□□ -0.65
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