Protein–RNA interactions for Protein: Q08AD1

CAMSAP2, Calmodulin-regulated spectrin-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMSAP2Q08AD1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
CAMSAP2Q08AD1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.09■■■■■ 4.17
CAMSAP2Q08AD1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC41.08■■■■■ 4.17
CAMSAP2Q08AD1 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
CAMSAP2Q08AD1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
CAMSAP2Q08AD1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC41.06■■■■■ 4.16
CAMSAP2Q08AD1 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC41.06■■■■■ 4.16
CAMSAP2Q08AD1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC41.06■■■■■ 4.16
CAMSAP2Q08AD1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
CAMSAP2Q08AD1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC41.05■■■■■ 4.16
CAMSAP2Q08AD1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
CAMSAP2Q08AD1 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
CAMSAP2Q08AD1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
CAMSAP2Q08AD1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.03■■■■■ 4.16
CAMSAP2Q08AD1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.02■■■■■ 4.16
CAMSAP2Q08AD1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC41.02■■■■■ 4.16
CAMSAP2Q08AD1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
CAMSAP2Q08AD1 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CAMSAP2Q08AD1 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC41■■■■■ 4.15
CAMSAP2Q08AD1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
CAMSAP2Q08AD1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC41■■■■■ 4.15
CAMSAP2Q08AD1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC41■■■■■ 4.15
CAMSAP2Q08AD1 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
CAMSAP2Q08AD1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.98■■■■■ 4.15
CAMSAP2Q08AD1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC40.97■■■■■ 4.15
CAMSAP2Q08AD1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.96■■■■■ 4.15
CAMSAP2Q08AD1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC40.96■■■■■ 4.15
CAMSAP2Q08AD1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC40.95■■■■■ 4.15
CAMSAP2Q08AD1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CAMSAP2Q08AD1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC40.94■■■■■ 4.14
CAMSAP2Q08AD1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
CAMSAP2Q08AD1 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CAMSAP2Q08AD1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CAMSAP2Q08AD1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
CAMSAP2Q08AD1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC40.91■■■■■ 4.14
CAMSAP2Q08AD1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC40.91■■■■■ 4.14
CAMSAP2Q08AD1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
CAMSAP2Q08AD1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
CAMSAP2Q08AD1 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC40.9■■■■■ 4.14
CAMSAP2Q08AD1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC40.86■■■■■ 4.13
CAMSAP2Q08AD1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC40.86■■■■■ 4.13
CAMSAP2Q08AD1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.84■■■■■ 4.13
CAMSAP2Q08AD1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
CAMSAP2Q08AD1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
CAMSAP2Q08AD1 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.82■■■■■ 4.12
CAMSAP2Q08AD1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
CAMSAP2Q08AD1 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
CAMSAP2Q08AD1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC40.78■■■■■ 4.12
CAMSAP2Q08AD1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
CAMSAP2Q08AD1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.77■■■■■ 4.12
CAMSAP2Q08AD1 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
CAMSAP2Q08AD1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC40.77■■■■■ 4.12
CAMSAP2Q08AD1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
CAMSAP2Q08AD1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
CAMSAP2Q08AD1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC40.76■■■■■ 4.12
CAMSAP2Q08AD1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC40.74■■■■■ 4.11
CAMSAP2Q08AD1 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
CAMSAP2Q08AD1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.73■■■■■ 4.11
CAMSAP2Q08AD1 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.73■■■■■ 4.11
CAMSAP2Q08AD1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.72■■■■■ 4.11
CAMSAP2Q08AD1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
CAMSAP2Q08AD1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
CAMSAP2Q08AD1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC40.7■■■■■ 4.11
CAMSAP2Q08AD1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC40.69■■■■■ 4.1
CAMSAP2Q08AD1 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
CAMSAP2Q08AD1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
CAMSAP2Q08AD1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
CAMSAP2Q08AD1 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.64■■■■■ 4.1
CAMSAP2Q08AD1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC40.64■■■■■ 4.1
CAMSAP2Q08AD1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC40.63■■■■■ 4.09
CAMSAP2Q08AD1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC40.63■■■■■ 4.09
CAMSAP2Q08AD1 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
CAMSAP2Q08AD1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
CAMSAP2Q08AD1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
CAMSAP2Q08AD1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
CAMSAP2Q08AD1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC40.6■■■■■ 4.09
CAMSAP2Q08AD1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
CAMSAP2Q08AD1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
CAMSAP2Q08AD1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC40.59■■■■■ 4.09
CAMSAP2Q08AD1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
CAMSAP2Q08AD1 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
CAMSAP2Q08AD1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
CAMSAP2Q08AD1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
CAMSAP2Q08AD1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC40.58■■■■■ 4.09
CAMSAP2Q08AD1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
CAMSAP2Q08AD1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.57■■■■■ 4.08
CAMSAP2Q08AD1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
CAMSAP2Q08AD1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
CAMSAP2Q08AD1 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC40.55■■■■■ 4.08
CAMSAP2Q08AD1 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
CAMSAP2Q08AD1 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
CAMSAP2Q08AD1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.08
CAMSAP2Q08AD1 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC40.51■■■■■ 4.08
CAMSAP2Q08AD1 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
CAMSAP2Q08AD1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
CAMSAP2Q08AD1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
CAMSAP2Q08AD1 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
CAMSAP2Q08AD1 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.49■■■■■ 4.07
CAMSAP2Q08AD1 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
CAMSAP2Q08AD1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC40.47■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms