Protein–RNA interactions for Protein: Q07954

LRP1, Prolow-density lipoprotein receptor-related protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 4,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1Q07954 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
LRP1Q07954 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRP1Q07954 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRP1Q07954 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
LRP1Q07954 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
LRP1Q07954 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRP1Q07954 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
LRP1Q07954 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRP1Q07954 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRP1Q07954 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
LRP1Q07954 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
LRP1Q07954 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRP1Q07954 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRP1Q07954 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRP1Q07954 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
LRP1Q07954 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
LRP1Q07954 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
LRP1Q07954 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
LRP1Q07954 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRP1Q07954 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRP1Q07954 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
LRP1Q07954 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
LRP1Q07954 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRP1Q07954 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRP1Q07954 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LRP1Q07954 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LRP1Q07954 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
LRP1Q07954 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRP1Q07954 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRP1Q07954 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LRP1Q07954 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LRP1Q07954 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LRP1Q07954 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LRP1Q07954 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LRP1Q07954 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LRP1Q07954 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LRP1Q07954 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LRP1Q07954 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LRP1Q07954 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRP1Q07954 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRP1Q07954 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRP1Q07954 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRP1Q07954 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP1Q07954 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP1Q07954 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP1Q07954 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRP1Q07954 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP1Q07954 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP1Q07954 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LRP1Q07954 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP1Q07954 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP1Q07954 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP1Q07954 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LRP1Q07954 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP1Q07954 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP1Q07954 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
LRP1Q07954 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP1Q07954 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP1Q07954 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP1Q07954 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
LRP1Q07954 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRP1Q07954 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRP1Q07954 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRP1Q07954 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRP1Q07954 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
LRP1Q07954 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRP1Q07954 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRP1Q07954 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRP1Q07954 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
LRP1Q07954 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRP1Q07954 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRP1Q07954 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
LRP1Q07954 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRP1Q07954 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
LRP1Q07954 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRP1Q07954 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
LRP1Q07954 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRP1Q07954 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
LRP1Q07954 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRP1Q07954 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRP1Q07954 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRP1Q07954 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LRP1Q07954 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP1Q07954 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LRP1Q07954 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP1Q07954 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP1Q07954 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP1Q07954 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP1Q07954 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP1Q07954 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LRP1Q07954 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LRP1Q07954 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRP1Q07954 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRP1Q07954 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRP1Q07954 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRP1Q07954 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LRP1Q07954 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP1Q07954 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP1Q07954 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
LRP1Q07954 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms