Protein–RNA interactions for Protein: Q00005

PPP2R2B, Serine/threonine-protein phosphatase 2A 55 kDa regulatory subunit B beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP2R2BQ00005 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP2R2BQ00005 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
PPP2R2BQ00005 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP2R2BQ00005 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
PPP2R2BQ00005 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP2R2BQ00005 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP2R2BQ00005 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP2R2BQ00005 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PPP2R2BQ00005 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP2R2BQ00005 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
PPP2R2BQ00005 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP2R2BQ00005 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP2R2BQ00005 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP2R2BQ00005 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP2R2BQ00005 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PPP2R2BQ00005 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP2R2BQ00005 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP2R2BQ00005 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PPP2R2BQ00005 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP2R2BQ00005 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PPP2R2BQ00005 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PPP2R2BQ00005 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP2R2BQ00005 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP2R2BQ00005 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP2R2BQ00005 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP2R2BQ00005 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PPP2R2BQ00005 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP2R2BQ00005 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP2R2BQ00005 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP2R2BQ00005 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PPP2R2BQ00005 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP2R2BQ00005 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP2R2BQ00005 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP2R2BQ00005 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP2R2BQ00005 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PPP2R2BQ00005 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP2R2BQ00005 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PPP2R2BQ00005 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP2R2BQ00005 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PPP2R2BQ00005 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PPP2R2BQ00005 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP2R2BQ00005 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP2R2BQ00005 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PPP2R2BQ00005 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP2R2BQ00005 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP2R2BQ00005 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PPP2R2BQ00005 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP2R2BQ00005 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
PPP2R2BQ00005 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PPP2R2BQ00005 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP2R2BQ00005 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP2R2BQ00005 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP2R2BQ00005 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
PPP2R2BQ00005 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
PPP2R2BQ00005 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP2R2BQ00005 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PPP2R2BQ00005 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP2R2BQ00005 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP2R2BQ00005 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP2R2BQ00005 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP2R2BQ00005 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PPP2R2BQ00005 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP2R2BQ00005 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PPP2R2BQ00005 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP2R2BQ00005 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP2R2BQ00005 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PPP2R2BQ00005 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP2R2BQ00005 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP2R2BQ00005 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP2R2BQ00005 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP2R2BQ00005 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP2R2BQ00005 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP2R2BQ00005 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PPP2R2BQ00005 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PPP2R2BQ00005 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PPP2R2BQ00005 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP2R2BQ00005 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PPP2R2BQ00005 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP2R2BQ00005 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP2R2BQ00005 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP2R2BQ00005 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PPP2R2BQ00005 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP2R2BQ00005 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP2R2BQ00005 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP2R2BQ00005 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PPP2R2BQ00005 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP2R2BQ00005 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP2R2BQ00005 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP2R2BQ00005 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PPP2R2BQ00005 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP2R2BQ00005 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PPP2R2BQ00005 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP2R2BQ00005 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PPP2R2BQ00005 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PPP2R2BQ00005 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PPP2R2BQ00005 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP2R2BQ00005 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP2R2BQ00005 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP2R2BQ00005 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PPP2R2BQ00005 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms