Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P61574 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
HERVK_113P61574 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
HERVK_113P61574 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
HERVK_113P61574 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
HERVK_113P61574 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P61574 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P61574 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
HERVK_113P61574 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P61574 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P61574 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P61574 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
HERVK_113P61574 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P61574 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P61574 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P61574 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P61574 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
HERVK_113P61574 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P61574 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P61574 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P61574 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P61574 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P61574 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
HERVK_113P61574 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P61574 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P61574 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P61574 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P61574 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P61574 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P61574 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P61574 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P61574 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
HERVK_113P61574 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P61574 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P61574 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P61574 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
HERVK_113P61574 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P61574 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P61574 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
HERVK_113P61574 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P61574 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P61574 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P61574 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P61574 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
HERVK_113P61574 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P61574 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P61574 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P61574 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P61574 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
HERVK_113P61574 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P61574 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
HERVK_113P61574 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P61574 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P61574 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P61574 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P61574 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P61574 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
HERVK_113P61574 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P61574 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
HERVK_113P61574 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
HERVK_113P61574 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P61574 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P61574 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
HERVK_113P61574 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P61574 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
HERVK_113P61574 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P61574 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P61574 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P61574 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
HERVK_113P61574 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P61574 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P61574 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P61574 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P61574 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
HERVK_113P61574 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P61574 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
HERVK_113P61574 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
HERVK_113P61574 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113P61574 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113P61574 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113P61574 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113P61574 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
HERVK_113P61574 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERVK_113P61574 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERVK_113P61574 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERVK_113P61574 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERVK_113P61574 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERVK_113P61574 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
HERVK_113P61574 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113P61574 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113P61574 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
HERVK_113P61574 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
HERVK_113P61574 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P61574 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
HERVK_113P61574 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERVK_113P61574 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
HERVK_113P61574 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P61574 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P61574 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERVK_113P61574 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.1 ms