Protein–RNA interactions for Protein: P60484

PTEN, Phosphatidylinositol 3,4,5-trisphosphate 3-phosphatase and dual-specificity protein phosphatase PTEN, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTENP60484 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTENP60484 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
PTENP60484 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTENP60484 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
PTENP60484 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
PTENP60484 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
PTENP60484 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
PTENP60484 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
PTENP60484 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTENP60484 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTENP60484 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
PTENP60484 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTENP60484 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
PTENP60484 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTENP60484 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
PTENP60484 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTENP60484 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
PTENP60484 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTENP60484 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTENP60484 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTENP60484 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
PTENP60484 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTENP60484 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
PTENP60484 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTENP60484 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
PTENP60484 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTENP60484 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTENP60484 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTENP60484 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
PTENP60484 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTENP60484 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTENP60484 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
PTENP60484 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
PTENP60484 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
PTENP60484 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTENP60484 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTENP60484 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
PTENP60484 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTENP60484 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTENP60484 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
PTENP60484 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTENP60484 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
PTENP60484 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
PTENP60484 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
PTENP60484 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTENP60484 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTENP60484 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTENP60484 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTENP60484 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
PTENP60484 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTENP60484 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTENP60484 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTENP60484 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
PTENP60484 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTENP60484 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTENP60484 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTENP60484 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTENP60484 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
PTENP60484 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTENP60484 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTENP60484 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTENP60484 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
PTENP60484 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTENP60484 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTENP60484 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTENP60484 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTENP60484 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
PTENP60484 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTENP60484 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
PTENP60484 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC29.25■■■□□ 2.27
PTENP60484 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PTENP60484 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTENP60484 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTENP60484 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
PTENP60484 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTENP60484 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTENP60484 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTENP60484 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PTENP60484 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTENP60484 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTENP60484 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTENP60484 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PTENP60484 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
PTENP60484 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTENP60484 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PTENP60484 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
PTENP60484 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PTENP60484 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTENP60484 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTENP60484 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTENP60484 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTENP60484 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTENP60484 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PTENP60484 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PTENP60484 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTENP60484 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTENP60484 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTENP60484 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PTENP60484 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PTENP60484 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms