Protein–RNA interactions for Protein: P56851

EDDM3B, Epididymal secretory protein E3-beta, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDDM3BP56851 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDDM3BP56851 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDDM3BP56851 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
EDDM3BP56851 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDDM3BP56851 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
EDDM3BP56851 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDDM3BP56851 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
EDDM3BP56851 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDDM3BP56851 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDDM3BP56851 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
EDDM3BP56851 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
EDDM3BP56851 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDDM3BP56851 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDDM3BP56851 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
EDDM3BP56851 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDDM3BP56851 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDDM3BP56851 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDDM3BP56851 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDDM3BP56851 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EDDM3BP56851 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDDM3BP56851 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDDM3BP56851 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDDM3BP56851 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EDDM3BP56851 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EDDM3BP56851 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDDM3BP56851 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EDDM3BP56851 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDDM3BP56851 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDDM3BP56851 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EDDM3BP56851 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDDM3BP56851 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EDDM3BP56851 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDDM3BP56851 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EDDM3BP56851 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
EDDM3BP56851 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EDDM3BP56851 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDDM3BP56851 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDDM3BP56851 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
EDDM3BP56851 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EDDM3BP56851 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDDM3BP56851 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDDM3BP56851 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EDDM3BP56851 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDDM3BP56851 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDDM3BP56851 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EDDM3BP56851 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDDM3BP56851 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDDM3BP56851 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDDM3BP56851 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDDM3BP56851 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDDM3BP56851 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EDDM3BP56851 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDDM3BP56851 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
EDDM3BP56851 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
EDDM3BP56851 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDDM3BP56851 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDDM3BP56851 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDDM3BP56851 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
EDDM3BP56851 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDDM3BP56851 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDDM3BP56851 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
EDDM3BP56851 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
EDDM3BP56851 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
EDDM3BP56851 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
EDDM3BP56851 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
EDDM3BP56851 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
EDDM3BP56851 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDDM3BP56851 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
EDDM3BP56851 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDDM3BP56851 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22■■□□□ 1.11
EDDM3BP56851 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
EDDM3BP56851 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDDM3BP56851 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
EDDM3BP56851 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDDM3BP56851 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDDM3BP56851 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
EDDM3BP56851 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDDM3BP56851 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDDM3BP56851 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDDM3BP56851 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
EDDM3BP56851 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDDM3BP56851 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDDM3BP56851 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDDM3BP56851 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
EDDM3BP56851 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDDM3BP56851 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDDM3BP56851 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDDM3BP56851 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDDM3BP56851 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDDM3BP56851 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
EDDM3BP56851 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
EDDM3BP56851 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDDM3BP56851 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDDM3BP56851 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDDM3BP56851 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
EDDM3BP56851 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
EDDM3BP56851 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDDM3BP56851 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDDM3BP56851 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
EDDM3BP56851 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms