Protein–RNA interactions for Protein: P55809

OXCT1, Succinyl-CoA:3-ketoacid coenzyme A transferase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OXCT1P55809 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
OXCT1P55809 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
OXCT1P55809 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
OXCT1P55809 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.41■■□□□ 1.98
OXCT1P55809 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
OXCT1P55809 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
OXCT1P55809 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
OXCT1P55809 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
OXCT1P55809 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
OXCT1P55809 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
OXCT1P55809 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
OXCT1P55809 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
OXCT1P55809 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
OXCT1P55809 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
OXCT1P55809 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
OXCT1P55809 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
OXCT1P55809 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
OXCT1P55809 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
OXCT1P55809 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
OXCT1P55809 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
OXCT1P55809 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
OXCT1P55809 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
OXCT1P55809 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
OXCT1P55809 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
OXCT1P55809 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
OXCT1P55809 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
OXCT1P55809 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
OXCT1P55809 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
OXCT1P55809 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
OXCT1P55809 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
OXCT1P55809 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
OXCT1P55809 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
OXCT1P55809 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
OXCT1P55809 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
OXCT1P55809 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
OXCT1P55809 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
OXCT1P55809 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
OXCT1P55809 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
OXCT1P55809 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
OXCT1P55809 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
OXCT1P55809 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
OXCT1P55809 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
OXCT1P55809 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
OXCT1P55809 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
OXCT1P55809 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
OXCT1P55809 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
OXCT1P55809 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
OXCT1P55809 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
OXCT1P55809 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
OXCT1P55809 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
OXCT1P55809 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
OXCT1P55809 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
OXCT1P55809 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
OXCT1P55809 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
OXCT1P55809 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
OXCT1P55809 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
OXCT1P55809 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
OXCT1P55809 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
OXCT1P55809 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
OXCT1P55809 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
OXCT1P55809 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
OXCT1P55809 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
OXCT1P55809 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
OXCT1P55809 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
OXCT1P55809 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
OXCT1P55809 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
OXCT1P55809 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
OXCT1P55809 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
OXCT1P55809 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
OXCT1P55809 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
OXCT1P55809 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
OXCT1P55809 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
OXCT1P55809 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
OXCT1P55809 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
OXCT1P55809 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
OXCT1P55809 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
OXCT1P55809 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
OXCT1P55809 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
OXCT1P55809 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
OXCT1P55809 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
OXCT1P55809 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
OXCT1P55809 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
OXCT1P55809 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
OXCT1P55809 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
OXCT1P55809 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
OXCT1P55809 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
OXCT1P55809 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
OXCT1P55809 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
OXCT1P55809 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
OXCT1P55809 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
OXCT1P55809 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
OXCT1P55809 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
OXCT1P55809 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
OXCT1P55809 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
OXCT1P55809 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
OXCT1P55809 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
OXCT1P55809 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
OXCT1P55809 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
OXCT1P55809 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
OXCT1P55809 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms