Protein–RNA interactions for Protein: P54762

EPHB1, Ephrin type-B receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 984 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB1P54762 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EPHB1P54762 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EPHB1P54762 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EPHB1P54762 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EPHB1P54762 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
EPHB1P54762 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
EPHB1P54762 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
EPHB1P54762 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
EPHB1P54762 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EPHB1P54762 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EPHB1P54762 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
EPHB1P54762 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
EPHB1P54762 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EPHB1P54762 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EPHB1P54762 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
EPHB1P54762 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EPHB1P54762 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EPHB1P54762 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
EPHB1P54762 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EPHB1P54762 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
EPHB1P54762 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EPHB1P54762 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
EPHB1P54762 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EPHB1P54762 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EPHB1P54762 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
EPHB1P54762 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EPHB1P54762 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
EPHB1P54762 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
EPHB1P54762 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
EPHB1P54762 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
EPHB1P54762 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
EPHB1P54762 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPHB1P54762 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
EPHB1P54762 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
EPHB1P54762 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EPHB1P54762 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
EPHB1P54762 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPHB1P54762 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPHB1P54762 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPHB1P54762 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPHB1P54762 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
EPHB1P54762 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
EPHB1P54762 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
EPHB1P54762 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPHB1P54762 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPHB1P54762 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPHB1P54762 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPHB1P54762 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
EPHB1P54762 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EPHB1P54762 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EPHB1P54762 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
EPHB1P54762 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
EPHB1P54762 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
EPHB1P54762 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
EPHB1P54762 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
EPHB1P54762 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
EPHB1P54762 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EPHB1P54762 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
EPHB1P54762 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EPHB1P54762 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
EPHB1P54762 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EPHB1P54762 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
EPHB1P54762 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
EPHB1P54762 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.79■■□□□ 1.88
EPHB1P54762 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPHB1P54762 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
EPHB1P54762 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPHB1P54762 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPHB1P54762 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPHB1P54762 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPHB1P54762 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPHB1P54762 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
EPHB1P54762 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPHB1P54762 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPHB1P54762 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
EPHB1P54762 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
EPHB1P54762 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPHB1P54762 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPHB1P54762 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPHB1P54762 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPHB1P54762 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
EPHB1P54762 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPHB1P54762 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPHB1P54762 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPHB1P54762 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
EPHB1P54762 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
EPHB1P54762 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPHB1P54762 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPHB1P54762 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPHB1P54762 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPHB1P54762 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPHB1P54762 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPHB1P54762 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPHB1P54762 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
EPHB1P54762 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
EPHB1P54762 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
EPHB1P54762 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPHB1P54762 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPHB1P54762 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
EPHB1P54762 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 163.4 ms