Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD23AP54725 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD23AP54725 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD23AP54725 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD23AP54725 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
RAD23AP54725 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD23AP54725 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD23AP54725 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
RAD23AP54725 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD23AP54725 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD23AP54725 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
RAD23AP54725 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD23AP54725 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
RAD23AP54725 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
RAD23AP54725 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAD23AP54725 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
RAD23AP54725 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD23AP54725 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD23AP54725 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD23AP54725 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
RAD23AP54725 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD23AP54725 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
RAD23AP54725 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD23AP54725 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
RAD23AP54725 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD23AP54725 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD23AP54725 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD23AP54725 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD23AP54725 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
RAD23AP54725 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD23AP54725 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD23AP54725 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD23AP54725 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
RAD23AP54725 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD23AP54725 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD23AP54725 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
RAD23AP54725 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD23AP54725 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD23AP54725 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
RAD23AP54725 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD23AP54725 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
RAD23AP54725 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD23AP54725 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
RAD23AP54725 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD23AP54725 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
RAD23AP54725 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD23AP54725 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD23AP54725 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
RAD23AP54725 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD23AP54725 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD23AP54725 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD23AP54725 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD23AP54725 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD23AP54725 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
RAD23AP54725 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD23AP54725 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
RAD23AP54725 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RAD23AP54725 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RAD23AP54725 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD23AP54725 FGF2-203ENST00000614010 867 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RAD23AP54725 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD23AP54725 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RAD23AP54725 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD23AP54725 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD23AP54725 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RAD23AP54725 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RAD23AP54725 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD23AP54725 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RAD23AP54725 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD23AP54725 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD23AP54725 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD23AP54725 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD23AP54725 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
RAD23AP54725 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD23AP54725 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
RAD23AP54725 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD23AP54725 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
RAD23AP54725 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD23AP54725 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD23AP54725 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
RAD23AP54725 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD23AP54725 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD23AP54725 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD23AP54725 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
RAD23AP54725 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD23AP54725 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD23AP54725 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
RAD23AP54725 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
RAD23AP54725 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD23AP54725 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD23AP54725 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD23AP54725 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
RAD23AP54725 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD23AP54725 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD23AP54725 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD23AP54725 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
RAD23AP54725 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD23AP54725 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD23AP54725 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
RAD23AP54725 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms