Protein–RNA interactions for Protein: P53804

TTC3, E3 ubiquitin-protein ligase TTC3, humanhuman

Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC3P53804 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
TTC3P53804 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TTC3P53804 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
TTC3P53804 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
TTC3P53804 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
TTC3P53804 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
TTC3P53804 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TTC3P53804 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TTC3P53804 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
TTC3P53804 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
TTC3P53804 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
TTC3P53804 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TTC3P53804 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
TTC3P53804 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTC3P53804 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTC3P53804 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TTC3P53804 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TTC3P53804 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
TTC3P53804 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TTC3P53804 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
TTC3P53804 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
TTC3P53804 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TTC3P53804 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
TTC3P53804 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TTC3P53804 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TTC3P53804 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
TTC3P53804 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
TTC3P53804 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
TTC3P53804 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
TTC3P53804 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC29.13■■■□□ 2.25
TTC3P53804 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TTC3P53804 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
TTC3P53804 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TTC3P53804 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TTC3P53804 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TTC3P53804 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TTC3P53804 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TTC3P53804 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TTC3P53804 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
TTC3P53804 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TTC3P53804 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TTC3P53804 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TTC3P53804 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TTC3P53804 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TTC3P53804 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TTC3P53804 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TTC3P53804 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TTC3P53804 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
TTC3P53804 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC29.04■■■□□ 2.24
TTC3P53804 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
TTC3P53804 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
TTC3P53804 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TTC3P53804 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TTC3P53804 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TTC3P53804 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TTC3P53804 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TTC3P53804 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TTC3P53804 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
TTC3P53804 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TTC3P53804 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
TTC3P53804 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TTC3P53804 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TTC3P53804 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
TTC3P53804 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
TTC3P53804 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
TTC3P53804 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
TTC3P53804 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TTC3P53804 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
TTC3P53804 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
TTC3P53804 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
TTC3P53804 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
TTC3P53804 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TTC3P53804 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TTC3P53804 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
TTC3P53804 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
TTC3P53804 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TTC3P53804 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TTC3P53804 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
TTC3P53804 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.94■■■□□ 2.22
TTC3P53804 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
TTC3P53804 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TTC3P53804 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTC3P53804 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.91■■■□□ 2.22
TTC3P53804 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
TTC3P53804 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
TTC3P53804 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
TTC3P53804 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TTC3P53804 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
TTC3P53804 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
TTC3P53804 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TTC3P53804 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTC3P53804 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTC3P53804 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTC3P53804 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTC3P53804 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTC3P53804 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
TTC3P53804 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
TTC3P53804 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TTC3P53804 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
TTC3P53804 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms