Protein–RNA interactions for Protein: P52948

NUP98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, humanhuman

Predictions only

Length 1,817 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP98P52948 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
NUP98P52948 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NUP98P52948 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NUP98P52948 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NUP98P52948 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NUP98P52948 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NUP98P52948 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NUP98P52948 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NUP98P52948 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NUP98P52948 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NUP98P52948 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
NUP98P52948 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
NUP98P52948 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC34■■■■□ 3.03
NUP98P52948 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
NUP98P52948 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NUP98P52948 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
NUP98P52948 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
NUP98P52948 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NUP98P52948 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NUP98P52948 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NUP98P52948 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NUP98P52948 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NUP98P52948 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
NUP98P52948 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NUP98P52948 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
NUP98P52948 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
NUP98P52948 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
NUP98P52948 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NUP98P52948 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NUP98P52948 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
NUP98P52948 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NUP98P52948 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NUP98P52948 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
NUP98P52948 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
NUP98P52948 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NUP98P52948 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NUP98P52948 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NUP98P52948 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
NUP98P52948 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
NUP98P52948 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NUP98P52948 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NUP98P52948 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NUP98P52948 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
NUP98P52948 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NUP98P52948 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NUP98P52948 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NUP98P52948 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NUP98P52948 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NUP98P52948 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NUP98P52948 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NUP98P52948 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
NUP98P52948 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC33.8■■■■□ 3
NUP98P52948 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
NUP98P52948 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC33.78■■■■□ 3
NUP98P52948 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.77■■■■□ 3
NUP98P52948 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
NUP98P52948 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NUP98P52948 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC33.74■■■□□ 2.99
NUP98P52948 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
NUP98P52948 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NUP98P52948 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NUP98P52948 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NUP98P52948 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
NUP98P52948 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
NUP98P52948 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NUP98P52948 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
NUP98P52948 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
NUP98P52948 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
NUP98P52948 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC33.69■■■□□ 2.98
NUP98P52948 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NUP98P52948 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
NUP98P52948 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC33.67■■■□□ 2.98
NUP98P52948 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
NUP98P52948 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
NUP98P52948 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC33.67■■■□□ 2.98
NUP98P52948 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NUP98P52948 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC33.65■■■□□ 2.98
NUP98P52948 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NUP98P52948 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NUP98P52948 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC33.64■■■□□ 2.98
NUP98P52948 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NUP98P52948 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NUP98P52948 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NUP98P52948 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NUP98P52948 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NUP98P52948 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NUP98P52948 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NUP98P52948 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NUP98P52948 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NUP98P52948 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NUP98P52948 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NUP98P52948 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NUP98P52948 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
NUP98P52948 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
NUP98P52948 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NUP98P52948 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
NUP98P52948 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
NUP98P52948 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
NUP98P52948 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
NUP98P52948 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.2 ms