Protein–RNA interactions for Protein: P50748

KNTC1, Kinetochore-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNTC1P50748 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KNTC1P50748 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
KNTC1P50748 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KNTC1P50748 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
KNTC1P50748 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
KNTC1P50748 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KNTC1P50748 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
KNTC1P50748 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KNTC1P50748 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
KNTC1P50748 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
KNTC1P50748 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
KNTC1P50748 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
KNTC1P50748 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
KNTC1P50748 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KNTC1P50748 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
KNTC1P50748 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
KNTC1P50748 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KNTC1P50748 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KNTC1P50748 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KNTC1P50748 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KNTC1P50748 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KNTC1P50748 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KNTC1P50748 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KNTC1P50748 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KNTC1P50748 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KNTC1P50748 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
KNTC1P50748 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KNTC1P50748 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KNTC1P50748 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNTC1P50748 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNTC1P50748 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNTC1P50748 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KNTC1P50748 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KNTC1P50748 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KNTC1P50748 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KNTC1P50748 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KNTC1P50748 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
KNTC1P50748 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KNTC1P50748 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KNTC1P50748 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KNTC1P50748 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNTC1P50748 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNTC1P50748 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNTC1P50748 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNTC1P50748 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KNTC1P50748 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KNTC1P50748 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KNTC1P50748 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KNTC1P50748 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KNTC1P50748 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KNTC1P50748 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KNTC1P50748 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KNTC1P50748 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KNTC1P50748 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KNTC1P50748 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KNTC1P50748 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KNTC1P50748 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KNTC1P50748 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KNTC1P50748 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KNTC1P50748 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KNTC1P50748 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KNTC1P50748 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KNTC1P50748 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KNTC1P50748 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KNTC1P50748 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KNTC1P50748 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
KNTC1P50748 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KNTC1P50748 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KNTC1P50748 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KNTC1P50748 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KNTC1P50748 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KNTC1P50748 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KNTC1P50748 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KNTC1P50748 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KNTC1P50748 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KNTC1P50748 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
KNTC1P50748 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KNTC1P50748 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KNTC1P50748 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KNTC1P50748 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.69
KNTC1P50748 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KNTC1P50748 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KNTC1P50748 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KNTC1P50748 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
KNTC1P50748 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
KNTC1P50748 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KNTC1P50748 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
KNTC1P50748 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
KNTC1P50748 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
KNTC1P50748 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
KNTC1P50748 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
KNTC1P50748 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
KNTC1P50748 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KNTC1P50748 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KNTC1P50748 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
KNTC1P50748 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
KNTC1P50748 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
KNTC1P50748 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KNTC1P50748 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
KNTC1P50748 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms