Protein–RNA interactions for Protein: P41440

SLC19A1, Folate transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC19A1P41440 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC19A1P41440 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SLC19A1P41440 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC19A1P41440 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC19A1P41440 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
SLC19A1P41440 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC19A1P41440 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC19A1P41440 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SLC19A1P41440 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC19A1P41440 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC19A1P41440 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SLC19A1P41440 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC19A1P41440 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SLC19A1P41440 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC19A1P41440 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC19A1P41440 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
SLC19A1P41440 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC19A1P41440 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SLC19A1P41440 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC19A1P41440 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC19A1P41440 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SLC19A1P41440 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC19A1P41440 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SLC19A1P41440 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC19A1P41440 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SLC19A1P41440 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC19A1P41440 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC19A1P41440 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SLC19A1P41440 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
SLC19A1P41440 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC19A1P41440 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC19A1P41440 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC19A1P41440 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SLC19A1P41440 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC19A1P41440 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC19A1P41440 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC19A1P41440 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC19A1P41440 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SLC19A1P41440 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC19A1P41440 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC19A1P41440 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SLC19A1P41440 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC19A1P41440 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC19A1P41440 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC19A1P41440 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SLC19A1P41440 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC19A1P41440 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC19A1P41440 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SLC19A1P41440 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC19A1P41440 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SLC19A1P41440 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC19A1P41440 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC19A1P41440 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SLC19A1P41440 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SLC19A1P41440 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC19A1P41440 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC19A1P41440 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC19A1P41440 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC19A1P41440 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC19A1P41440 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SLC19A1P41440 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC19A1P41440 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC19A1P41440 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SLC19A1P41440 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC19A1P41440 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC19A1P41440 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
SLC19A1P41440 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SLC19A1P41440 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC19A1P41440 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SLC19A1P41440 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC19A1P41440 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SLC19A1P41440 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC19A1P41440 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC19A1P41440 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC19A1P41440 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC19A1P41440 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
SLC19A1P41440 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC19A1P41440 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC19A1P41440 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
SLC19A1P41440 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC19A1P41440 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC19A1P41440 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC19A1P41440 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
SLC19A1P41440 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC19A1P41440 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
SLC19A1P41440 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.72
SLC19A1P41440 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC19A1P41440 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC19A1P41440 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC19A1P41440 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC19A1P41440 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC19A1P41440 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC19A1P41440 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC19A1P41440 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SLC19A1P41440 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC19A1P41440 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SLC19A1P41440 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC19A1P41440 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC19A1P41440 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
SLC19A1P41440 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms