Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC42.92■■■■■ 4.46
CLIP1P30622 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
CLIP1P30622 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC42.91■■■■■ 4.46
CLIP1P30622 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC42.89■■■■■ 4.46
CLIP1P30622 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
CLIP1P30622 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.89■■■■■ 4.46
CLIP1P30622 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC42.88■■■■■ 4.46
CLIP1P30622 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.88■■■■■ 4.45
CLIP1P30622 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
CLIP1P30622 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
CLIP1P30622 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
CLIP1P30622 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
CLIP1P30622 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
CLIP1P30622 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.82■■■■■ 4.45
CLIP1P30622 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC42.8■■■■■ 4.44
CLIP1P30622 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
CLIP1P30622 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
CLIP1P30622 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC42.78■■■■■ 4.44
CLIP1P30622 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC42.78■■■■■ 4.44
CLIP1P30622 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC42.77■■■■■ 4.44
CLIP1P30622 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
CLIP1P30622 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC42.77■■■■■ 4.44
CLIP1P30622 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.77■■■■■ 4.44
CLIP1P30622 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
CLIP1P30622 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
CLIP1P30622 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
CLIP1P30622 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
CLIP1P30622 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.75■■■■■ 4.43
CLIP1P30622 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC42.75■■■■■ 4.43
CLIP1P30622 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
CLIP1P30622 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC42.74■■■■■ 4.43
CLIP1P30622 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
CLIP1P30622 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
CLIP1P30622 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
CLIP1P30622 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
CLIP1P30622 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC42.71■■■■■ 4.43
CLIP1P30622 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.71■■■■■ 4.43
CLIP1P30622 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.71■■■■■ 4.43
CLIP1P30622 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
CLIP1P30622 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
CLIP1P30622 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
CLIP1P30622 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
CLIP1P30622 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
CLIP1P30622 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
CLIP1P30622 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
CLIP1P30622 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC42.66■■■■■ 4.42
CLIP1P30622 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
CLIP1P30622 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC42.65■■■■■ 4.42
CLIP1P30622 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
CLIP1P30622 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
CLIP1P30622 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
CLIP1P30622 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
CLIP1P30622 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC42.63■■■■■ 4.41
CLIP1P30622 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
CLIP1P30622 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
CLIP1P30622 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
CLIP1P30622 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC42.61■■■■■ 4.41
CLIP1P30622 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC42.61■■■■■ 4.41
CLIP1P30622 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
CLIP1P30622 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC42.6■■■■■ 4.41
CLIP1P30622 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
CLIP1P30622 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC42.6■■■■■ 4.41
CLIP1P30622 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC42.58■■■■■ 4.41
CLIP1P30622 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC42.57■■■■■ 4.41
CLIP1P30622 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.41
CLIP1P30622 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
CLIP1P30622 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
CLIP1P30622 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.56■■■■■ 4.4
CLIP1P30622 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
CLIP1P30622 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
CLIP1P30622 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC42.55■■■■■ 4.4
CLIP1P30622 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
CLIP1P30622 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
CLIP1P30622 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
CLIP1P30622 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
CLIP1P30622 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC42.51■■■■■ 4.4
CLIP1P30622 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.51■■■■■ 4.4
CLIP1P30622 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
CLIP1P30622 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
CLIP1P30622 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.5■■■■■ 4.39
CLIP1P30622 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
CLIP1P30622 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
CLIP1P30622 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC42.49■■■■■ 4.39
CLIP1P30622 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
CLIP1P30622 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
CLIP1P30622 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
CLIP1P30622 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC42.46■■■■■ 4.39
CLIP1P30622 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
CLIP1P30622 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
CLIP1P30622 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC42.45■■■■■ 4.39
CLIP1P30622 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.39
CLIP1P30622 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.39
CLIP1P30622 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC42.44■■■■■ 4.38
CLIP1P30622 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
CLIP1P30622 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
CLIP1P30622 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC42.42■■■■■ 4.38
CLIP1P30622 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC42.42■■■■■ 4.38
CLIP1P30622 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC42.42■■■■■ 4.38
CLIP1P30622 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.39■■■■■ 4.38
CLIP1P30622 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC42.38■■■■■ 4.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms