Protein–RNA interactions for Protein: P27352

GIF, Gastric intrinsic factor, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIFP27352 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GIFP27352 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GIFP27352 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GIFP27352 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
GIFP27352 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
GIFP27352 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
GIFP27352 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GIFP27352 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GIFP27352 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
GIFP27352 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GIFP27352 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
GIFP27352 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GIFP27352 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GIFP27352 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GIFP27352 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GIFP27352 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GIFP27352 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
GIFP27352 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GIFP27352 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GIFP27352 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GIFP27352 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GIFP27352 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GIFP27352 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GIFP27352 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GIFP27352 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GIFP27352 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GIFP27352 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GIFP27352 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GIFP27352 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GIFP27352 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GIFP27352 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GIFP27352 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GIFP27352 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GIFP27352 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GIFP27352 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GIFP27352 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GIFP27352 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIFP27352 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIFP27352 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIFP27352 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIFP27352 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIFP27352 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GIFP27352 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GIFP27352 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GIFP27352 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GIFP27352 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GIFP27352 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIFP27352 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GIFP27352 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GIFP27352 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIFP27352 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GIFP27352 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIFP27352 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIFP27352 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GIFP27352 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIFP27352 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIFP27352 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GIFP27352 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GIFP27352 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GIFP27352 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GIFP27352 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GIFP27352 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GIFP27352 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GIFP27352 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GIFP27352 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GIFP27352 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GIFP27352 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
GIFP27352 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
GIFP27352 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
GIFP27352 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GIFP27352 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GIFP27352 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GIFP27352 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GIFP27352 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GIFP27352 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GIFP27352 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GIFP27352 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
GIFP27352 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GIFP27352 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GIFP27352 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GIFP27352 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
GIFP27352 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GIFP27352 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
GIFP27352 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GIFP27352 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GIFP27352 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GIFP27352 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GIFP27352 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
GIFP27352 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GIFP27352 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GIFP27352 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GIFP27352 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GIFP27352 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GIFP27352 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GIFP27352 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GIFP27352 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GIFP27352 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GIFP27352 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GIFP27352 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GIFP27352 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms