Protein–RNA interactions for Protein: P11474

ESRRA, Steroid hormone receptor ERR1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 423 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESRRAP11474 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
ESRRAP11474 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ESRRAP11474 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
ESRRAP11474 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
ESRRAP11474 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ESRRAP11474 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
ESRRAP11474 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
ESRRAP11474 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
ESRRAP11474 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
ESRRAP11474 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
ESRRAP11474 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
ESRRAP11474 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
ESRRAP11474 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
ESRRAP11474 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
ESRRAP11474 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
ESRRAP11474 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
ESRRAP11474 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
ESRRAP11474 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ESRRAP11474 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ESRRAP11474 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ESRRAP11474 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
ESRRAP11474 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ESRRAP11474 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ESRRAP11474 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
ESRRAP11474 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
ESRRAP11474 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ESRRAP11474 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ESRRAP11474 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ESRRAP11474 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ESRRAP11474 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ESRRAP11474 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ESRRAP11474 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ESRRAP11474 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ESRRAP11474 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ESRRAP11474 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ESRRAP11474 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ESRRAP11474 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ESRRAP11474 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
ESRRAP11474 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ESRRAP11474 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ESRRAP11474 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ESRRAP11474 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ESRRAP11474 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ESRRAP11474 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ESRRAP11474 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ESRRAP11474 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ESRRAP11474 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ESRRAP11474 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ESRRAP11474 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ESRRAP11474 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ESRRAP11474 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ESRRAP11474 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ESRRAP11474 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ESRRAP11474 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ESRRAP11474 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ESRRAP11474 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ESRRAP11474 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ESRRAP11474 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ESRRAP11474 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ESRRAP11474 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ESRRAP11474 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ESRRAP11474 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ESRRAP11474 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ESRRAP11474 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ESRRAP11474 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ESRRAP11474 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ESRRAP11474 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ESRRAP11474 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ESRRAP11474 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ESRRAP11474 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ESRRAP11474 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ESRRAP11474 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ESRRAP11474 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ESRRAP11474 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ESRRAP11474 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ESRRAP11474 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ESRRAP11474 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ESRRAP11474 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ESRRAP11474 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ESRRAP11474 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ESRRAP11474 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ESRRAP11474 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ESRRAP11474 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ESRRAP11474 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ESRRAP11474 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ESRRAP11474 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ESRRAP11474 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ESRRAP11474 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ESRRAP11474 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ESRRAP11474 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ESRRAP11474 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ESRRAP11474 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ESRRAP11474 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
ESRRAP11474 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ESRRAP11474 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ESRRAP11474 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ESRRAP11474 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ESRRAP11474 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
ESRRAP11474 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ESRRAP11474 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.9 ms