Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
ATXN8OSP0DMR3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATXN8OSP0DMR3 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATXN8OSP0DMR3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
ATXN8OSP0DMR3 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
ATXN8OSP0DMR3 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATXN8OSP0DMR3 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ATXN8OSP0DMR3 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATXN8OSP0DMR3 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATXN8OSP0DMR3 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ATXN8OSP0DMR3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATXN8OSP0DMR3 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATXN8OSP0DMR3 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATXN8OSP0DMR3 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ATXN8OSP0DMR3 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
ATXN8OSP0DMR3 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATXN8OSP0DMR3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATXN8OSP0DMR3 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATXN8OSP0DMR3 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
ATXN8OSP0DMR3 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
ATXN8OSP0DMR3 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATXN8OSP0DMR3 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATXN8OSP0DMR3 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATXN8OSP0DMR3 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ATXN8OSP0DMR3 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ATXN8OSP0DMR3 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATXN8OSP0DMR3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ATXN8OSP0DMR3 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATXN8OSP0DMR3 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ATXN8OSP0DMR3 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATXN8OSP0DMR3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ATXN8OSP0DMR3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATXN8OSP0DMR3 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATXN8OSP0DMR3 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ATXN8OSP0DMR3 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ATXN8OSP0DMR3 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATXN8OSP0DMR3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATXN8OSP0DMR3 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ATXN8OSP0DMR3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATXN8OSP0DMR3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
ATXN8OSP0DMR3 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATXN8OSP0DMR3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ATXN8OSP0DMR3 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN8OSP0DMR3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN8OSP0DMR3 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN8OSP0DMR3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN8OSP0DMR3 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN8OSP0DMR3 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ATXN8OSP0DMR3 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATXN8OSP0DMR3 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ATXN8OSP0DMR3 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ATXN8OSP0DMR3 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ATXN8OSP0DMR3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ATXN8OSP0DMR3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ATXN8OSP0DMR3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
ATXN8OSP0DMR3 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATXN8OSP0DMR3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ATXN8OSP0DMR3 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN8OSP0DMR3 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN8OSP0DMR3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN8OSP0DMR3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN8OSP0DMR3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN8OSP0DMR3 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN8OSP0DMR3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN8OSP0DMR3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ATXN8OSP0DMR3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN8OSP0DMR3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN8OSP0DMR3 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN8OSP0DMR3 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ATXN8OSP0DMR3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN8OSP0DMR3 RGS1-203ENST00000469578 1034 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ATXN8OSP0DMR3 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATXN8OSP0DMR3 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ATXN8OSP0DMR3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATXN8OSP0DMR3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATXN8OSP0DMR3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATXN8OSP0DMR3 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ATXN8OSP0DMR3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN8OSP0DMR3 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN8OSP0DMR3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN8OSP0DMR3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATXN8OSP0DMR3 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATXN8OSP0DMR3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATXN8OSP0DMR3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATXN8OSP0DMR3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATXN8OSP0DMR3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATXN8OSP0DMR3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATXN8OSP0DMR3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATXN8OSP0DMR3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATXN8OSP0DMR3 AP001002.2-201ENST00000625137 386 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATXN8OSP0DMR3 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATXN8OSP0DMR3 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATXN8OSP0DMR3 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATXN8OSP0DMR3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATXN8OSP0DMR3 MTATP6P19-201ENST00000413797 659 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATXN8OSP0DMR3 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ATXN8OSP0DMR3 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ATXN8OSP0DMR3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATXN8OSP0DMR3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ATXN8OSP0DMR3 YIPF7-202ENST00000415895 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms