Protein–RNA interactions for Protein: P0DKX4

SMIM18, Small integral membrane protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM18P0DKX4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM18P0DKX4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SMIM18P0DKX4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMIM18P0DKX4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SMIM18P0DKX4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM18P0DKX4 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM18P0DKX4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM18P0DKX4 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SMIM18P0DKX4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM18P0DKX4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM18P0DKX4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SMIM18P0DKX4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM18P0DKX4 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM18P0DKX4 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SMIM18P0DKX4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMIM18P0DKX4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SMIM18P0DKX4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SMIM18P0DKX4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMIM18P0DKX4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMIM18P0DKX4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMIM18P0DKX4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SMIM18P0DKX4 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM18P0DKX4 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM18P0DKX4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SMIM18P0DKX4 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMIM18P0DKX4 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SMIM18P0DKX4 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMIM18P0DKX4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMIM18P0DKX4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SMIM18P0DKX4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM18P0DKX4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM18P0DKX4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM18P0DKX4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM18P0DKX4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SMIM18P0DKX4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SMIM18P0DKX4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM18P0DKX4 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SMIM18P0DKX4 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SMIM18P0DKX4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM18P0DKX4 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM18P0DKX4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SMIM18P0DKX4 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMIM18P0DKX4 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMIM18P0DKX4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SMIM18P0DKX4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMIM18P0DKX4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMIM18P0DKX4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SMIM18P0DKX4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMIM18P0DKX4 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SMIM18P0DKX4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM18P0DKX4 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM18P0DKX4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM18P0DKX4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SMIM18P0DKX4 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMIM18P0DKX4 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SMIM18P0DKX4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMIM18P0DKX4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMIM18P0DKX4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SMIM18P0DKX4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMIM18P0DKX4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMIM18P0DKX4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SMIM18P0DKX4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SMIM18P0DKX4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM18P0DKX4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM18P0DKX4 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM18P0DKX4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SMIM18P0DKX4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SMIM18P0DKX4 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM18P0DKX4 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SMIM18P0DKX4 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMIM18P0DKX4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SMIM18P0DKX4 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMIM18P0DKX4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SMIM18P0DKX4 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SMIM18P0DKX4 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SMIM18P0DKX4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMIM18P0DKX4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SMIM18P0DKX4 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMIM18P0DKX4 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SMIM18P0DKX4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SMIM18P0DKX4 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMIM18P0DKX4 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SMIM18P0DKX4 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMIM18P0DKX4 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SMIM18P0DKX4 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMIM18P0DKX4 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SMIM18P0DKX4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SMIM18P0DKX4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SMIM18P0DKX4 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM18P0DKX4 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM18P0DKX4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM18P0DKX4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SMIM18P0DKX4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SMIM18P0DKX4 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM18P0DKX4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SMIM18P0DKX4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SMIM18P0DKX4 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SMIM18P0DKX4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SMIM18P0DKX4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SMIM18P0DKX4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms