Protein–RNA interactions for Protein: P09919

CSF3, Granulocyte colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3P09919 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CSF3P09919 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CSF3P09919 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSF3P09919 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CSF3P09919 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSF3P09919 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSF3P09919 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSF3P09919 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSF3P09919 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSF3P09919 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSF3P09919 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSF3P09919 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSF3P09919 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CSF3P09919 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSF3P09919 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSF3P09919 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSF3P09919 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSF3P09919 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSF3P09919 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CSF3P09919 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSF3P09919 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
CSF3P09919 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CSF3P09919 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSF3P09919 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSF3P09919 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CSF3P09919 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSF3P09919 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CSF3P09919 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSF3P09919 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSF3P09919 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSF3P09919 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSF3P09919 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSF3P09919 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSF3P09919 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSF3P09919 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSF3P09919 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSF3P09919 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSF3P09919 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSF3P09919 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSF3P09919 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF3P09919 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF3P09919 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF3P09919 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSF3P09919 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSF3P09919 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSF3P09919 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSF3P09919 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF3P09919 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSF3P09919 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF3P09919 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF3P09919 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF3P09919 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSF3P09919 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSF3P09919 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSF3P09919 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSF3P09919 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSF3P09919 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSF3P09919 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSF3P09919 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSF3P09919 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSF3P09919 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSF3P09919 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSF3P09919 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSF3P09919 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSF3P09919 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSF3P09919 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSF3P09919 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSF3P09919 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSF3P09919 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSF3P09919 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CSF3P09919 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF3P09919 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CSF3P09919 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF3P09919 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF3P09919 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF3P09919 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF3P09919 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSF3P09919 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
CSF3P09919 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSF3P09919 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSF3P09919 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF3P09919 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF3P09919 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSF3P09919 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSF3P09919 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSF3P09919 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CSF3P09919 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSF3P09919 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSF3P09919 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CSF3P09919 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
CSF3P09919 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.45■■□□□ 1.35
CSF3P09919 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF3P09919 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF3P09919 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSF3P09919 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
CSF3P09919 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSF3P09919 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSF3P09919 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSF3P09919 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSF3P09919 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms