Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
PARP1P09874 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PARP1P09874 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PARP1P09874 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
PARP1P09874 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
PARP1P09874 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PARP1P09874 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
PARP1P09874 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PARP1P09874 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.1■■■□□ 2.57
PARP1P09874 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
PARP1P09874 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
PARP1P09874 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
PARP1P09874 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.07■■■□□ 2.56
PARP1P09874 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
PARP1P09874 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
PARP1P09874 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.05■■■□□ 2.56
PARP1P09874 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
PARP1P09874 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
PARP1P09874 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
PARP1P09874 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PARP1P09874 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
PARP1P09874 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PARP1P09874 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.03■■■□□ 2.56
PARP1P09874 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
PARP1P09874 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PARP1P09874 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.55
PARP1P09874 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PARP1P09874 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PARP1P09874 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PARP1P09874 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
PARP1P09874 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31■■■□□ 2.55
PARP1P09874 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PARP1P09874 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
PARP1P09874 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
PARP1P09874 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PARP1P09874 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PARP1P09874 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PARP1P09874 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
PARP1P09874 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
PARP1P09874 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PARP1P09874 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC30.98■■■□□ 2.55
PARP1P09874 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
PARP1P09874 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PARP1P09874 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
PARP1P09874 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
PARP1P09874 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
PARP1P09874 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
PARP1P09874 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
PARP1P09874 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
PARP1P09874 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PARP1P09874 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
PARP1P09874 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PARP1P09874 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PARP1P09874 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
PARP1P09874 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
PARP1P09874 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.93■■■□□ 2.54
PARP1P09874 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
PARP1P09874 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PARP1P09874 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
PARP1P09874 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PARP1P09874 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
PARP1P09874 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
PARP1P09874 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PARP1P09874 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PARP1P09874 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
PARP1P09874 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC30.9■■■□□ 2.54
PARP1P09874 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
PARP1P09874 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC30.89■■■□□ 2.54
PARP1P09874 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
PARP1P09874 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
PARP1P09874 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PARP1P09874 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
PARP1P09874 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
PARP1P09874 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
PARP1P09874 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.82■■■□□ 2.52
PARP1P09874 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
PARP1P09874 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PARP1P09874 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PARP1P09874 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PARP1P09874 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PARP1P09874 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PARP1P09874 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
PARP1P09874 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.81■■■□□ 2.52
PARP1P09874 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PARP1P09874 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PARP1P09874 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
PARP1P09874 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
PARP1P09874 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
PARP1P09874 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
PARP1P09874 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PARP1P09874 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PARP1P09874 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
PARP1P09874 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
PARP1P09874 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
PARP1P09874 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PARP1P09874 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
PARP1P09874 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
PARP1P09874 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
PARP1P09874 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC30.75■■■□□ 2.51
PARP1P09874 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms