Protein–RNA interactions for Protein: P08118

MSMB, Beta-microseminoprotein, humanhuman

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSMBP08118 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MSMBP08118 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSMBP08118 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSMBP08118 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSMBP08118 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MSMBP08118 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSMBP08118 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSMBP08118 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MSMBP08118 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MSMBP08118 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSMBP08118 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSMBP08118 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MSMBP08118 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSMBP08118 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSMBP08118 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MSMBP08118 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSMBP08118 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MSMBP08118 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSMBP08118 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSMBP08118 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
MSMBP08118 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSMBP08118 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSMBP08118 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
MSMBP08118 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSMBP08118 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
MSMBP08118 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSMBP08118 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSMBP08118 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSMBP08118 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
MSMBP08118 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSMBP08118 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
MSMBP08118 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSMBP08118 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
MSMBP08118 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSMBP08118 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSMBP08118 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MSMBP08118 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSMBP08118 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MSMBP08118 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSMBP08118 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSMBP08118 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSMBP08118 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MSMBP08118 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
MSMBP08118 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSMBP08118 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
MSMBP08118 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSMBP08118 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSMBP08118 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSMBP08118 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSMBP08118 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
MSMBP08118 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
MSMBP08118 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSMBP08118 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
MSMBP08118 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSMBP08118 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSMBP08118 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
MSMBP08118 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSMBP08118 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSMBP08118 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
MSMBP08118 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
MSMBP08118 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MSMBP08118 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
MSMBP08118 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
MSMBP08118 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSMBP08118 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
MSMBP08118 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
MSMBP08118 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
MSMBP08118 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
MSMBP08118 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MSMBP08118 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
MSMBP08118 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
MSMBP08118 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
MSMBP08118 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MSMBP08118 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
MSMBP08118 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
MSMBP08118 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
MSMBP08118 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
MSMBP08118 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MSMBP08118 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
MSMBP08118 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MSMBP08118 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MSMBP08118 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MSMBP08118 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MSMBP08118 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
MSMBP08118 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
MSMBP08118 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
MSMBP08118 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSMBP08118 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSMBP08118 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSMBP08118 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSMBP08118 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSMBP08118 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSMBP08118 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
MSMBP08118 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
MSMBP08118 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSMBP08118 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSMBP08118 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
MSMBP08118 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSMBP08118 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
MSMBP08118 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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