Protein–RNA interactions for Protein: P07437

TUBB, Tubulin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP07437 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
TUBBP07437 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
TUBBP07437 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUBBP07437 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUBBP07437 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUBBP07437 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUBBP07437 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
TUBBP07437 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
TUBBP07437 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUBBP07437 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUBBP07437 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
TUBBP07437 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
TUBBP07437 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
TUBBP07437 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUBBP07437 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUBBP07437 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
TUBBP07437 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
TUBBP07437 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
TUBBP07437 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
TUBBP07437 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
TUBBP07437 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
TUBBP07437 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBBP07437 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
TUBBP07437 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBBP07437 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBBP07437 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TUBBP07437 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TUBBP07437 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TUBBP07437 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBBP07437 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBBP07437 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TUBBP07437 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TUBBP07437 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TUBBP07437 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TUBBP07437 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TUBBP07437 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TUBBP07437 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
TUBBP07437 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TUBBP07437 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TUBBP07437 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TUBBP07437 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TUBBP07437 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TUBBP07437 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUBBP07437 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
TUBBP07437 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUBBP07437 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUBBP07437 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUBBP07437 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TUBBP07437 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUBBP07437 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
TUBBP07437 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TUBBP07437 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TUBBP07437 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TUBBP07437 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TUBBP07437 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TUBBP07437 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TUBBP07437 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUBBP07437 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TUBBP07437 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUBBP07437 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUBBP07437 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TUBBP07437 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUBBP07437 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
TUBBP07437 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
TUBBP07437 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
TUBBP07437 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
TUBBP07437 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
TUBBP07437 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUBBP07437 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUBBP07437 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
TUBBP07437 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBBP07437 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
TUBBP07437 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
TUBBP07437 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
TUBBP07437 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
TUBBP07437 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBBP07437 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBBP07437 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
TUBBP07437 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
TUBBP07437 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUBBP07437 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
TUBBP07437 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUBBP07437 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUBBP07437 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUBBP07437 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
TUBBP07437 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBBP07437 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBBP07437 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBBP07437 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
TUBBP07437 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUBBP07437 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUBBP07437 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUBBP07437 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
TUBBP07437 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TUBBP07437 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
TUBBP07437 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
TUBBP07437 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TUBBP07437 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
TUBBP07437 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
TUBBP07437 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.1 ms